| | |
|---|
| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/00216224:14330/08:00024175 |
| Název v původním jazyce | From Simple Regulatory Motifs to Parallel Model Checking of Complex Transcriptional Networks |
| Druh | D - Článek ve sborníku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | IN - Informatika |
| Rok uplatnění | 2008 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 5 |
| Počet domácích tvůrců | 5 |
| Tvůrce | Barnat Jiří (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce) |
| Tvůrce | Brim Luboš (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce) |
| Tvůrce | Černá Ivana (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce) |
| Tvůrce | Dražan Sven (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce) |
| Tvůrce | Šafránek David (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; G - garant výsledku) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | The central mechanism which drives every living cell is protein synthesis, the so-called transcription, which is realized according to the genetic code. There are complex regulatory interactions that control transcription of genes to proteins. Owing to their inherent complexity, analysis of dynamical models of such interactions requires a scalable computational approach. In this paper we employ parallel LTL model checking for a case study of selected dynamic properties of an in silico model of transcription in Bacillus subtilis, a bacterium living in soil. Moreover, we show the general fact that crucial LTL properties characterising transcriptional dynamics can be inferred from network motifs commonly studied in systems biology. |
| Klíčová slova | transcriptional networks; model checking; B. subtilis |
| Název sborníku | Proceedings of PDMC 2008 - Parallel and Distributed Methods ins VerifiCation |
| ISSN | 1571-0661 |
| Počet stran výsledku | 15 |
| Název nakladatele | Ivana Cerna and Gerald Luettgen |
| Místo vydání | Budapest |
| Místo konání akce | Budapest |
| Rok konání akce | 2008 |
| Typ akce podle státní příslušnoti účastníků | WRD - Světová |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Masarykova univerzita / Fakulta informatiky |
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2010 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV10-MSM-14330___/01:1 |
| Datum dodání | 13.5.2010 |
| Specifikace | RIV/00216224:14330/08:00024175!RIV10-MSM-14330___ |
| Kontrolní kód | [8D84A7F92DA8] |
| Další výskyty tohoto výsledku od stejného předkladatele |
| Dodáno AV ČR v roce 2010 | Záznam s identifikačním kódem RIV/00216224:14330/08:00024175 v dodávce dat RIV10-AV0-14330___/01:1 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | 1ET408050503 - Techniky automatické verifikace a validace softwarových a hardwarových systémů (2005-2009, AV0/1E) |
| Projekt | 1M0545 - Institut Teoretické Informatiky (2005-2011, MSM/1M) |
| Výzkumný záměr | MSM0021622419 - Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy (2005-2011, MSM) |