• česky
  • english

LN00A032 - Struktura a dynamika komplexních molekulových systémů a biomolekul (2000-2004, MSM/LN)

Údaje o projektu
Identifikační kódLN00A032
Důvěrnost údajůS - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
Název v původním jazyceStruktura a dynamika komplexních molekulových systémů a biomolekul
PoskytovatelMSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT)
ProgramLN - Výzkumná centra (2000-2004)
Kategorie VaVNV - Aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového výzkumu (tzv. "neprůmyslový výzkum")
Hlavní oborCF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Vedlejší oborCH - Jaderná a kvantová chemie, fotochemie
Zahájení řešení07/2000
Ukončení řešení12/2004
Zahájení poskytování účelové podpory07/2000
Ukončení poskytování účelové podpory12/2004
Poslední stav řešeníU - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení
Finance projektu
Období20002001200220032004celkem
Výše podpory ze státního rozpočtu17 822 tis. Kč23 644 tis. Kč13 644 tis. Kč19 644 tis. Kč13 644 tis. Kč88 398 tis. Kč
Celkové uznané náklady23 597 tis. Kč35 194 tis. Kč25 194 tis. Kč31 194 tis. Kč19 383 tis. Kč134 562 tis. Kč
Typskutečně čerpanéskutečně čerpanéskutečně čerpanéskutečně čerpanéskutečně čerpané
Druh soutěžeVS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacíchSMSM0031008 - Veřejná soutěž (MSM/LN)
Cíle řešení v původním jazyceZaměření výzkumného a školícího centra bude na teoretické, výpočetní a experimentální studium struktury, energetiky, dynamiky a reaktivity molekulových klastrů, molekulových sítí, DNA a proteinů jak v plynné tak v kapalné fázi.Výhodou navrhovaného projektu je interdisciplinární přístup a úzká spolupráce teoretiků a experimentátorů v rámci centra.Ke studiu bude použit široký soubor výpočetních techik, zahrnujících kvantově chemické výpočty, simulace klasické a kvantové molekulové dynamiky a metodu Monte Carlo, jakož I flourescenční a femtosekundovou spektroskopii.Řešení projektu bude mít významný dopad na molekulové vědy, biotechnologie, lékařství, katalýzu a ochranu životního prostředí.
Klíčová slova v anglickém jazycemolecular clusters, biomolecules, DNA, proteins, molecular sieves, quantum chemistry, molecular dynamics, Monte Carlo, fluorescence spectroscopy, femtosecond spectroscopy
Hodnocení výsledkůV - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
Zhodnocení výsledků řešení českyCentrum dosáhlo špičkových výsledků ve výpočetním a experimentálním studiu struktury a dynamiky komplexních molekulových systémů: především biomolekul v plynné fázi a jejich hydratace, reaktivity kovů v molekulových sítech, heterogenní chemie vodných aer
Rok dodání údajů do CEP2005
Systémové označení dodávky datCEP/2005/MSM/MSM5LN/U/N/4:2
Datum dodání záznamu28.5.2008
Účastníci projektu
Počet příjemců1
Počet dalších účastníků projektu3
PříjemceÚstav fyzikální chemie J. Heyrovského AV ČR, v.v.i.
ŘešitelDoc. Ing. Pavel Hobza, DrSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika; tel.: +420-(0)2-66052056; fax: +420-(0)2-8582307)
Další účastník projektuÚstav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
ŘešitelRNDr. Zdeněk Havlas, DrSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Další účastník projektuFyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
ŘešitelDr. Petr Kužel (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Další účastník projektu / Organizační jednotka garantující řešeníVysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemicko-inženýrská
ŘešitelProf. Ing. Anatol Malijevsky, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007
Výsledky projektu v RIV
Počet výsledků v RIV223
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00318446 - The Amino Group in Adenine: MP2 and CCSD(T) Complete Basis Set Limit Calculations of the Planarization Barrier and DFT/B3LYP Study of the Anharmonic Frequencies of Adenine (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/06:00048041 - Cation-.pi. complexes between alkali metal cation and para-halogenophenols. Structures, binding energies and thermodynamic properties: DFT study and CCSD(T) complete basis set limit calculations (2006)
Výsledek druhu CRIV/61388955:_____/06:00044280 - Some aspects of DNA condensation observed by fluorescence correlation spectroscopy (2006)
Výsledek druhu CRIV/67985858:_____/06:00028950 - Towards the Role of the Range of Intermolecular Interactions in Fluids (2006)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/05:00020937 - Ab initio electronic structure of thymine anions (2005)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/05:00021123 - Acidities of nitrous and nitric acids (2005)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/05:00021120 - Basicity of carboxylic acids: resonance in the cation and substituent effects (2005)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/05:00030360 - Broad-band dielectric spectroscopy of PZN-8% PT single crystal (2005)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/05:00023574 - Characterization of the Cu+ sites in MFI zeolites: combined computational and experimental study (2005)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/05:00029074 - Comparision of the dielectric response of relaxor PbMg1/3Nb2/3O3 ceramics and single crystals (2005)
Výsledek druhu ORIV/60461373:22340/05:00014790 - Density expansion of the pair correlation and bridge functions of the hard sphere fluid (2005)
Výsledek druhu BRIV/61388955:_____/04:00107591 - Fluorescence Spectroscopy in Biology. Advanced Methods and their Applications to Membranes, Proteins, DNA, and Cells (2004)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/05:00021327 - High frquency dielectric properties of CaTiO3-based microwave ceramics (2005)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/05:00025725 - Knowledge-based elastic potentials for docking drugs or proteins with nucleic acids (2005)
Výsledek druhu DRIV/61388963:_____/05:00027703 - Molecular dynamics study of the conformational behavior of branched glycopeptides during the solid-phase synthesis. The effect of insert and terminal groups (2005)
Výsledek druhu ORIV/60461373:22340/05:00014789 - Nonanalytical equation of state of the hard sphere fluid (2005)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/05:00021133 - Steric effects in isolated molecules: Gas-phase basicity of methyl-substituted acetophenones (2005)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/05:00027546 - Ultrafast far-infrared dynamics probed by terahertz: A frequency domain approach. I. Model systems (2005)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100888 - A density functional study of EPR hyperfine coupling of vanadocene(IV) complexes (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101109 - A Polar Isomer of Formic Acid Dimer Formed in Helium Nanodroplets (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100886 - A theoretical study of the MgNC/MgCN isomerization in the electronic ground state (2004)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/04:00011110 - Accurate equation of state of the hard sphere fluid in stable and metastable regions (2004)
Výsledek druhu JRIV/68081707:_____/04:00104705 - Accurate interaction energies of hydrogen-bonded nucleic acid base pairs (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100787 - Analysis of the ortho effect: acidity of 2-substituted benzoic acids (2004)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/04:00011154 - Asimtotičeskoje zamykanije dlja uravnenija Ornštejna-Cernike i problema fazovych perechodov (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100878 - Attenuation of the substituent effects along the aliphatic chain (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101128 - The Barrier to Internal Rotation and Electronic Effects in para-Halogenophenols: Theoretical Study (2004)
Výsledek druhu CRIV/61388955:_____/04:00107590 - Basics of Fluorescence Spectroscopy in Bio-sciences (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100864 - Bulk versus Interfacial Aqueous Solvation of Dicarboxylate Dianions (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100895 - Calculation of the photodetachment cross sections of the HCN- and HNC- dipole-bound anions as described by a one-electron Drude model (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00102847 - Calculations of the site specific stretching frequencies of CO adsorbed on Li+/ZSM-5 (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101121 - CCSDT and CCSD(T) Calculations on Model H-Bonded and Stacked Complexes (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100865 - Complex autocorrelation function and energy spectrum by classical trajectory calculations (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101110 - Correlated ab Initio Study of Nucleic Acid Bases and Their Tautomers in the Gas Phase, in a Microhydrated Environment and in Aqueous Solution. Part 3. Adenine (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00102864 - Counter-ion effects and interfacial properties of aqueous tetrabutylammonium halide solutions (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00102848 - The dihydrogen bond in X3C-H...H-M complexes (X = F, Cl, Br; M = Li, Na, K). A correlated quantum chemical ab initio and density functional theory study (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00101969 - DNA deformability at the base pair level (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00102440 - Efficiency of a second-generation HIV-1 protease inhibitor studied by molecular dynamics and absolute binding free energy calculations (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100880 - Electron binding to nucleic acid bases. Experimental and theoretical studies (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00101970 - Enthalpies of formation of monoderivatives of hydrocarbons: Interaction of polar groups with an alkyl group (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100862 - Ferrocene-modified purines as potential electrochemical markers: synthesis, crystal structures, electrochemistry and cytostatic activity of (ferrocenylethynyl)-and (ferrocenylethyl)purines (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101111 - First Local Minimum of the Formic Acid Dimer Exhibits Simultaneously Red-shifted O-H... O and Improper Blue-shifted C-H... O Hydrogen Bonds (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100786 - Geometry at the aliphatic tertiary carbon atom: computational and experimental test of the Walsh rule (2004)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/04:00011003 - Global phase diagrams of the van der Waals-Dieterici and the BMCSL-Dieterici equations of state (2004)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/04:00100302 - High-frequency dielectric spectroscopy and soft lattice dynamics of disordered ferroelectrics (2004)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/04:00029286 - High-temperature phase transitions in SrBi2Ta2O9 film: a study by THz spectroscopy (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101127 - The Infrared Spectrum of CN in Its Ground Electronic State (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100785 - Interaction of two groups in a molecule through a double bond: concept of the pi-inductive effect (2004)
Výsledek druhu JRIV/68081707:_____/04:00104703 - Interactions of hydrated divalent metal cations with nucleic acid bases. How to relate the gas phase data to solution situation and binding selectivity in nucleic acids (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100870 - Isomer selective IR experiments and correlated ab initio quantum chemical calculations support planar H-bonded structure of the 7-methyl adenine...adenine and stacked structure of the 9-methyl adenine base pairs (2004)
Výsledek druhu WRIV/60461373:22340/04:00011174 - Liquid Matter Workshop 2004 (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100889 - Localization of Cu+ sites and framework Al positions in high-silica zeolites: Combined experimental and theoretical study (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00107125 - Metal cation - methyl interactions in CB11Me12 - salts of Me3Ge+, Me3Sn+, and Me3Pb+ (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100887 - The mid-IR absorption spectrum of gas-phase clusters of the nucleobases guanine and cytosine (2004)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/04:00011109 - Molecular dynamics of potential models with polarizability: comparison of methods (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00102845 - Molecular dynamics study of the effect of the gamma-Abu insert on the conformational behavior of the glycopeptide dendrimers based on the oligolysine scaffold in N, N'-dimethylformamide (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100867 - Molecular structure of surface-active salt solutions: Photoelectron spectroscopy and molecular dynamics simulations of aqueous tetrabutylammonium iodide (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100890 - Nature of the Cu+ -NO bond in the gas phase and at different types of Cu+ sites in zeolite catalysts (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101126 - New Rotation-Vibration Band and Potential Energy Function of NeH+ in the Ground Electronic State (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100894 - Nonadiabatic chemical reaction triggered by electron photodetachment: An ab initio quantum dynamical study (2004)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/04:00100466 - Optical pump-terahertz probe spectroscopy of dyes in solutions: Probing the synamics of liquid solvent or solid precipitate? (2004)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/04:00029276 - Optical rectification at metal surfaces (2004)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/04:00029155 - Optical two-photon absorption in GaAs measured by optical-pump terahertz-probe spectroscopy (2004)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/04:00011153 - Phase behavior of symmetric binary mixtures with partially miscible components in spherical pores. Density functional approach. (2004)
Výsledek druhu CRIV/61388955:_____/04:00101129 - Photodissociation of Hydrogen Halides in a Cryogenic Rare Gas Environment: A Complex Approach to Simulations of Cluster Experiments (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101130 - Photodissociation of Hydrogen Iodide on the Surface of Large Argon Clusters: The Orientation of the Librational Wave Function and the Scattering from the Cluster Cage (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100885 - Potential energy surface of the cytosine dimer: MP2 complete basis set limit interaction energies, CCSD(T) correction term, and comparison with the AMBER force field (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100789 - Prediction of molecular dipole moments from bond moments: testing of the method by DFT calculations on isolated molecules (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00101960 - Proteinases of betaretroviruses bind single-stranded nucleic acids through a novel interaction module, the G-patch (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100891 - Pyrrole as a probe molecule for characterization of basic sites in ZSM-5: A combined FTIR spectroscopy and computional study (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00101979 - Restricted conformational flexibility of furanose derivatives: Ab initio interpretation of their nuclear spin-spin coupling constants (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100863 - RNA conformational classes (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100788 - Scope and limitation of the inductive effect: importance of charged substituents (2004)
Výsledek druhu CRIV/61388955:_____/04:00107589 - Solvent Relaxation as a Tool for Probing Micro-Polarity and -Fluidity (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00107615 - Solvent Relaxation in Biomembranes (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101026 - Solvent-Mediated Folding of a Doubly Charged Anion (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100791 - Steric inhibition of resonance: revision of the principle on the electronic spectra of methyl-substituted acetophenones (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101140 - Structure and Hydrogen Bonding of 2-aminopyridine·(H2O)n (n=1,2) Studied by Infrared Ion Depletion Spectroscopy (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101141 - Structure and Hydrogen Bonding of Different Isomers of 2-Aminopyridine.NH3 Studied by IR/R2PI Spectroscopy (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00107576 - Surface-Dependent Transitions during Self-Assembly of Phospholipid Membranes on Mica, Silica, and Glass (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101139 - Synthesis and Characterization and Structural Investigation of the First Vanadocene(IV) Carboxylic Acid Complexes Prepared fron the Vanadocene Dichloride (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/04:00101036 - Theoretical Calculation of the NMR Spin-Spin Coupling Constants and the NMR Shifts Allow Distinguishability between the Specific Direct and the Water-Mediated Binding of a Divalent Metal Cation to Guanine (2004)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/04:00029272 - Thermaly tunable filter for terahertz range based on a one-dimensional photonic crystal with a defect (2004)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/04:00100499 - Time-domain terahertz spectroscopy of SrBi2Ta2O9./sub (2004)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/04:00100470 - Time-domain terahertz study of defect formation in one-dimensional photonic crystals (2004)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/04:00011108 - Time-Reversible Always Stable Predictor-Corrector Method for Molecular Dynamics of Polarizable Molecules (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100790 - Validity of the Hammett equation for isolated molecules: basicity of 3- and 4-substituted benzonitriles (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/04:00100784 - 13C and 1H nuclear magnetic resonance of methyl-substituted acetophenones and methyl benzoates: steric hindrance and inhibited conjugation (2004)
Výsledek druhu WRIV/60461373:22340/04:00011071 - 3rd Summer School of Theoretical and Computational Chemistry (2004)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:00107679 - Acetic Acid Dimer in the Gas Phase, Nonpolar Solvent, Microhydrated Environment, and Dilute and Concentrated Acetic Acid: Ab initio Quantum Chemical and Molecular Dynamics Simulations (2003)
Výsledek druhu DRIV/00216208:11310/03:00000586 - Amphiphilic block copolymer micelles in polar and aqueous media. Experimental study and computer simulations (2003)
Výsledek druhu CRIV/61388955:_____/03:54030217 - Applications of Optical Spectroscopy. Chapter 6. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030045 - Associating Oligonucleotides with Positively Charged Liposomes. (2003)
Výsledek druhu CRIV/61388955:_____/03:54030218 - Basics of Optical Spectroscopy. Chapter 3. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030211 - Bilayer Localization of Membrane-Active Peptides Studied in Biomimetic Vesicles by Visible and Fluorescence Spectroscopies. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030184 - Bound and Continuum Vibrational States of the Bifluoride Anion. (2003)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/03:00007480 - Calculation of elementary diagrams using Metropolis-like simulation method (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030215 - Calculations of Site-Specific CO Stretching Frequencies for Copper Carbonyls with the 'Near Spectroscopic Accuracy': CO Interaction with Cu+/MFI. (2003)
Výsledek druhu DRIV/68378271:_____/03:00101805 - Carrier dynamics in low-temperature grown GaAs studied by THz emission spectroscopy (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030115 - Characterization of the Cu+ Sites in High-Silica Zeolites Interacting with CO Molecule: Combined Computational and Experimental Study. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030113 - Coordination of Alkali Metal Ions in ZSM-5: A Combined Quantum Mechanics/Interatomic Potential Function Study. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:00107677 - Correlated ab inito Study of Nucleic Acid Bases and Their Tautomers in the Gas Phase, in a Microhydrated Environment and in Aqueous Solution. Guanine: Surprising Stabilization of Rare Tautomers in Aqueous Solution (2003)
Výsledek druhu JRIV/68081707:_____/03:17033295 - DNA basepair step deformability inferred from molecular dynamics simulations. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030008 - The Effect of Water Solvent on NMR Spin- Spin Couplings in DNA: Improvement of Calculated Values by Application of Two Solvent Models. (2003)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22310/03:00007889 - Electrostatic Calculation of the Substituent Effect: An Efficient Test on Isolated Molecules (2003)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/03:00100355 - The ferroelectric soft mode and central mode in SrBi2Ta2O9 films (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030047 - Fluorescence Correlation Spectroscopy Using Octadecylrhodamine B as a Specific Micelle-Binding Fluorescent Tag, Light Scattering and Tapping Mode Atomic Force Microscopy Studies of Amphiphilic Water-Soluble Block Copolymer Micelles. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030048 - How to Determine Diffusion Coefficients in Planar Phospholipid Systems by Confocal Fluorescence Correlation Spectroscopy. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61389013:_____/03:55033179 - Hybrid block copolymer micelles with partly hydrophobically modified polyelectrolyte shells in polar and aqueous media: Experimental study using fluorescence correlation spectroscopy, time-resolved fluorescence, light scattering, and atomic force microsc (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030028 - Hydration of Sulpho and Methyl Groups in Dimethyl Sulfoxide is Accompanied by Formation of Red-Shifted Hydrogen Bonds and Improper Blue-Shifted Hydrogen Bonds: An ab initio Quantum Chemical Study. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030210 - Impact, Trapping, and Accommodation of Hydroxyl Radical and Ozone at Salt Aerosol Surfaces: A Molecular Dynamics Study. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030198 - Light Scattering, Atomic Force Microscopy and Fluorescence Correlation Spectroscopy Studies of Polystyrene-block-poly(2-vinylpyridine)-block-poly(ethylene oxide) Micelles. (2003)
Výsledek druhu BRIV/61388955:_____/03:54030229 - Methods and Applications of Fluorescence. Book of Abstracts. (2003)
Výsledek druhu JRIV/68081707:_____/03:17033078 - Molecular dynamics simulations and thermodynamics analysis of DNA-drug complexes. Minor groove binding between 4',6-diamidino-2-phenylindole and DNA duplexes in solution. (2003)
Výsledek druhu JRIV/68081707:_____/03:17033093 - Molecular interactions of nucleic acid bases. A review of quantum-chemical studies. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030196 - New Parameterization of the Cornell et al Empirical Force Field Covering Amino Group Nonplanarity in Nucleic Acid Bases. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030199 - Octadecylrhodamine B as A Specific Micelle-Binding Fluorescent Tag for Fluorescence Correlation Spectroscopy Studies of Amphiphilic Water-Soluble Block Copolymer Micelles. Spectroscopic Behavior in Aqueous Media. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/03:57030103 - Ortho effect and steric inhibition of resonance: basicities of methyl-substituted acetophenones. (2003)
Výsledek druhu JRIV/68081707:_____/03:17033121 - Outer-shell and inner-shell coordination of phosphate group to hydrated metal ions (Mg2+, Cu2+, Zn2+, Cd2+) in the presence and absence of nucleobase. The role of nonelectrostatic effects. (2003)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/03:00100315 - Phase-sensitive time-domain terahertz reflection spectroscopy (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030106 - Photodissociation of HBr in and on Arn Clusters: The Role of the Position of the Molecule. (2003)
Výsledek druhu CRIV/61388955:_____/03:54030057 - Physical Properties and Atmospheric Reactivity of Aqueous Sea Salt Micro-Aerosols. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030144 - Pickup and Photodissociation of Hydrogen Halides in Floppy Neon Clusters. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54020241 - Polarizability and Aqueous Solvation of the Sulfate Dianion. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030111 - Polarizability of the Nitrate Anion and Its Solvation at the Air/Water Interface. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030269 - Pyrol jako testovací molekula k charakterizaci ZSM-5 s ionty alkalických kovů: Kombinace teoretické a experimentální studie. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030105 - Quantum Simulations of Vibrational Dephasing of Molecules in a Cryogenic Environment: HArF in an Argon Cluster. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/03:57030363 - Racemization barriers of 1,1'-binaphthyl and 1,1'-binaphthalene-2,2'-diol: A DFT Study. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030112 - Salt Crystallization from an Evaporating Aqueous Solution by Molecular Dynamics Simulations. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/03:57030342 - Sexual attraction in the silkworm moth: nature of binding of bombykol in pheromone binding protein - an ab initio study . (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/03:57030303 - Spin-orbit coupling in biradicals. 4. Zero-field splitting in triplet nitrenes, phosphinidenes, and arsinidenes. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030100 - State-of-the-art Correlated ab initio Potential Energy Curves for Heavy Rare Gas Dimers: Ar2, Kr2 and Xe2. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030114 - Theoretical Investigation of the Vibrational Dynamics of Ag+CO Solvated in the Ne Matrix. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/03:57030407 - Theoretical studies of metal ion selectivity. 3. A theoretical design of the most specific combinations of functional groups representing amino acid side chains for the selected metal ions (Co 2+ , Ni 2+ , Cu 2+ , Zn 2+ , Cd 2+ , Hg 2+ ). (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030149 - Theoretical Study of Pyrrole Interaction with Alkali Metal Exchanged Zeolites: Investigation of the Reliability of Cluster and Periodic Models. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:00100821 - True Stabilization Energies for the Optimal Planar Hydrogen-Bonded and Stacked Structures of GuanineĎCytosine, AdenineĎThymine and Their 9- and 1-Methyl Derivatives: Complete Basis Set Calculations at the MP2 and CCSD(T) Levels and Comparison with Exp... (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/03:57030079 - Using DFT methods for the prediction of the structure and energetics of metal-binding sites in metalloproteins. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030258 - Van der Waals Attraction and Coalescence of Aqueous Salt Nanodroplets. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030185 - Vibrational Linestrengths for the Ground and First Excited Electronic States of HeH2+. (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/03:54030023 - Why is the N1-H stretch vibration frequency of guanine shifted upon dimerization to the red and the amino N-H stretch vibration frequency to the blue? (2003)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020055 - The Application of Fluorescence Correlation Spectroscopy in Detecting DNA Condensation. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020122 - Bound and Low-Lying Quasi-Bound Rotation-Vibration Energy Levels of the Ground and First Excited Electronic States of HeH2+. (2002)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/02:00007026 - The bridge function of hard spheres by direct inversion of computer simulation data (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020053 - Chloride Anion on Aqueous Clusters at the Air-Water Interface, and in Liquid Water: Solvent Effects on Cl- Polarizability. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/02:57020070 - Conformation of the dipeptide cyclo(L-Pro-L-Pro) monitored by the nuclear magnetic resonance and Raman optical activity spectra. Experimental and ab initio computational study. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020091 - Correlated ab initio Study of Nucleic Acid Bases and Their Tautomers in the Gas Phase, Microhydrated Environment, and in Aqueous Solution. Part 1. Cytosine. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020086 - Critical Effect of the N2 Amino Group on Structure, Dynamics, and Elasticity of DNA Polypurine Tracts. (2002)
Výsledek druhu DRIV/61388963:_____/02:57030174 - Design of protease and amylase inhibitory motifs by combinatorial peptide libraries. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020057 - The Effect of Spermine on Plasmid Condensation and Dye Release Observed by Fluorescence Correlation Spectroscopy. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020066 - Electronic Properties, Hydrogen Bonding, Stacking, and Cation Binding of DNA and RNA Bases. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020040 - Electrons Weakly Bound to Hydrogen Bonded Clusters: A Pseudopotential Model Including Dispersion Interactions. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020052 - Excited States of Iodide Anions in Water: A Comparison of the Electronic Structure in Clusters and in Bulk Solution. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020092 - Exploring the Structure of a DNA Hairpin with the Help of NMR Spin-Spin Coupling Constants: An Experimental and Quantum Chemical Investigation. (2002)
Výsledek druhu CRIV/61388955:_____/02:54020112 - Fluorescence Approaches for the Characterisation of the Peripheral Membrane Binding of Proteins Applied for the Blood Coagulation Protein Prothrombin. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020013 - Fluorescence Correlation Spectroscopy (FCS) as a Tool to Study DNA Condensation with Hexadecyltrimethylammonium Bromide (HTAB). (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/02:57020120 - Free-thiol Cys331 exposed during activation process is critical for native tetramer structure of cathepsin C (dipeptidyl peptidase I). (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54030099 - Improper, Blue-Shifting Hydrogen Bond. (2002)
Výsledek druhu DRIV/61388955:_____/02:54020132 - Interaction of Small Molecules with Transition Metal Ions in Zeolites: The Effect of the Local Environment. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020065 - Intercalators. 1. Nature of Stacking Interactions between Intercalators (Ethidium, Daunomycin, Ellipticine and 4'',6-Diaminide-2-phenylindole) and DNA Base Pairs. Ab initio Quantum Chemical, Density Functional Theory and Empirical Potentional Study. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020021 - Ions at the Air Water Interface. (2002)
Výsledek druhu CRIV/61388955:_____/02:54030097 - Membrane Binding of Peripheral Proteins and its Characterisation Applying Fluorescence Methods. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020244 - Možnosti moderní počítačové chemie pro popis vlastností přechodných kovů v zeolitech. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020059 - Muscovite(Mica) Allows the Characterisation of Supported Bilayers by Ellipsometry and Confocal Fluorescence Correlation Spectroscopy. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020172 - On the Convergence of the (.delta.ECCSD(T) -.delta.EMP2) Term for Complexes with Multiple H-bonds. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020007 - On the Existence of Cu(I) Dimers in ZSM-5 - A Computational Study. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020058 - On What Time Scale Does Solvent Relaxation in Phospholipid Bilayers Happen? (2002)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/02:02030186 - Phase transition in lead titanate thin films: a Brillouin study. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020026 - Potential Energy and Free Energy Surfaces of the Formic Acid Dimer: Correlared ab initio Calculations and Molecular Dynamics Simulations. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020185 - Potential Energy Surface and Ro-vibrational Energies of Ne3+ in the Ground Electronic State. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020199 - Protein and Drug Interactions in the Minor Groove of DNA. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020249 - Quantum Dynamics and Spectroscopy of Electron Photodetachment in Cl-...H2O and Cl-...D2O Complexes. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020015 - Solvent Relaxation in Phospholipid Bilayers: Physical Understanding and Biophysical Applications. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020236 - Stacked Structure of the Glycine Dimer is More Stable than the Cyclic Planar Geometry with Two O-H...O Hydrogen Bonds: Concerted Action of Empirical, High-level Nonempirical ab initio, and Experimetal Studies. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/02:57020341 - Study of the nature of improper blue-shifting hydrogen bonding and standard hydrogen bonding in the X 3 CH...OH 2 and XH...OH 2 complexes (X=F, Cl, Br, I): a correlated ab initio study. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/02:57020275 - Synthesis of [5]-, [6]-, and [7]helicene via Ni(0)- or Co(I)- catalyzed isomerization of aromatic 'cis,cis' dienetriynes. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/02:57020260 - Teoretické studium interakcí přechodných kovů s biomolekulami. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020160 - Theoretical Investigation of the Effect of the Rare Gas Matrices on the Vibrational Spectra of Solvated Molecular Ions: Cu+CO. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/02:57020342 - Theoretical studies of metal ion selectivity. 2. DFT calculations of complexation energies of selected transition metal ions (Co 2+ , Ni 2+ , Cu 2+ , Zn 2+ , Cd 2+ , and Hg 2+ ) in metal-binding sites of metalloproteins. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020246 - Time-resolved Tryptophan Fluorescence of Fragment 1-86 of Factor X and the Influence of Membrane Binding. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/02:54020121 - Towards True DNA Base Stacking Energies: MP2, CCSD(T) and Complete Basis Set Calculations. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/02:57020244 - Unusual binding mode of an HIV-1 protease inhibitor explains its potency against multi-grug-resistant virus strains. (2002)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010176 - A Systematic ab initio Study of the Hydration of Selected Palladium Square-Planar Complexes. A Comparison with Platinum Analogues. (2001)
Výsledek druhu DRIV/61388955:_____/01:54010081 - Ab initio Simulation of Cu-Species in Zeolites: Siting, Coordination, UV-VIS Spectra and Reactivity. (2001)
Výsledek druhu ARIV/60461373:22340/01:00004335 - An Accurate Bridge function of Hard-Sphere System from Computer Simulation Data. (2001)
Výsledek druhu CRIV/61388955:_____/01:54010217 - Anthroyloxy Fatty Acids: a Unique Set of Fluorescent Probes for the Investigation of Membrane Structure and Dynamics. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010063 - At Nonzero Temperatures, Stacked Structures of Methylated Nucleic Acid Base Pairs and Microhydrated Nonmethylated Nucleic Acid Base Pairs are Favored over Planar Hydrogen-Bonded Structures; A Molecular Dynamics Simulations Study. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010227 - Can Ordinary Single-Reference Coupled-Cluster Methods Describe Potential Energy Surfaces with Nearly Spectroscopic Accuracy? The Renormalized Coupled-Cluster Study of the Vibrational Spectrum of HF. (2001)
Výsledek druhu JRIV/68378271:_____/01:02010378 - Carrier dynamics in low-temperature grown GaAs studied by terahertz emission spectroscopy. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010219 - Characterization of Ag+ Sites in ZSM-5: A Combined Quantum Mechanics/Interatomic Potential Function Study. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010134 - Chemical Oscillations Based on Photoautocatalysis of Ozone. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010114 - Coumarin 6, Hypericin, Resorufins, and Flavins: Suitable Chromophores for Fluorescence Correlation Spectroscopy of Biological Molecules. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010221 - Critical Evaluation of the Prediction of the Dissociation Energy and the Energy Spectrum of the Ground State of KRb by the Reduced Potential Curve Method. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/01:57010205 - Enhanced long-range Si...N interactions in organosilicon cations. A theoretical study. (2001)
Výsledek druhu ARIV/60461373:22340/01:00004371 - Fluid-Fluid Phase Equilibria in Hard-Sphere Binary Mixtures. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010084 - The H-Index Unambiguously Discriminates between Hydrogen Bonding and Improper Blue-Shifting Hydrogen Bonding. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010202 - How Nucleobases Rotate When Bonded to a Metal Ion: Detailed View from an ab initio Quantum Chemical Study of a Cytosine Complex of trans-a 2 PT II . (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010024 - Hydrogen Bonding and Stacking Interactions of Nucleid Acid Base Pairs: A Density-Functional-Theory Based Treatment. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010177 - Hydrogen Bonding, Stacking and Cation Binding of DNA Bases. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/01:57010222 - Improper, blue-shifting hydrogen bond between fluorobenzene and fluoroform. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010178 - The Influence of Square Planar Platinum Complexes on DNA Bases Pairing. An ab initio DFT Study. (2001)
Výsledek druhu JRIV/67985823:_____/01:20010241 - Interactions between allosteric modulators and 4-DAMP and other antagonists at muscarinic receptors: potential significance of the distance between the N and Carboxyl C atoms in the molecules of antagonists. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010228 - Inversion Splittings of SiH 3 - . An ab initio Study. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/01:57010169 - Magnesium and biological activity of oxytocin analogues modified on aromatic ring of amino acid in position 2. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/01:57010199 - Metodika kvantově-chemických výpočtů systémů obsahujících přechodné kovy. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010210 - Molecular Structure of Salt Solutions: A New View of the Interface with Implications for Heterogeneous Atmospheric Chemistry. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010229 - Multidimensional WKB Approximation and the Lifetime Calculation. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/01:57010221 - The nature of improper, blue-shifting hydrogen bonding verified experimentally. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010160 - Nonadiabatic Interactions between the Ground and Low-lying Excited Electronic States: Vibronic States of the Cl-HCl Complex. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010116 - Potential Energy and Free Energy Surfaces of All Ten Canonical and Methylated Nucleic Acid Base Pairs: Molecular Dynamics and Quantum Chemical ab initio Studies. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010118 - Preference of Cluster Isomers as a Result of Quantum Delocalization: Potential Energy Surfaces and Intermolecular Vibrational States of Ne...HBr, Ne...HI, and HI(Ar)n (n=1-6). (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010092 - Protonation of Platinated Adenine Nucleobases. Gas Phase vs Condensed Phase Picture. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010220 - RI-MP2 Calculations with Extended Basis Sets - a Promising Tool for Study of H-bonded and Stacked DNA Base Pairs. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010209 - Small Doped 3 He Clusters: A Systematic Quantum Chemistry Approach to Fermionic Nuclear Wave Functions and Energies. (2001)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/01:00004344 - Structures and Properties of Hard Sphere Mixtures Based on a Self-Consistent Integral Equation (2001)
Výsledek druhu WRIV/61388955:_____/01:54010267 - Summer School on Theoretical and Computational Chemistry. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/01:54010133 - Surface Solvation of Halogen Anions in Water Clusters: An ab initio Molecular Dynamics Study of the Cl-(H 2 O) 6 Complex. (2001)
Výsledek druhu DRIV/60461373:22340/01:00004451 - Teoretický popis termodynamických vlastností reálných látek (2001)
Výsledek druhu DRIV/60461373:22340/01:00004370 - Termodynamika a struktura systémů tuhých koulí (2001)
Výsledek druhu DRIV/60461373:22340/01:00004334 - Výpočty vlastností směsí molekulárních tekutin pomocí integrálních rovnic. (2001)
Výsledek druhu WRIV/61388955:_____/01:54010265 - Winter School of Computational Chemistry and Biochemistry. (2001)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/00:54000177 - Already Two Water Molecules Change Planar H-bonded Structure of the Adenine...Thymine Base Pair to the Stacked Ones: a Molecular Dynamics Simulation Study. (2000)
Výsledek druhu JRIV/61388955:_____/00:54000175 - Blue-Shifting Hydrogen Bonds. (2000)
Výsledek druhu JRIV/61389013:_____/00:55010286 - Tři přístupy k počítačovému modelování struktury a interakcí velkých molekul. (2000)