| | |
|---|
| Údaje o projektu |
| Identifikační kód | KJB601630606 |
| Důvěrnost údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Název v původním jazyce | Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae) |
| Poskytovatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR) |
| Program | KJ - Juniorské badatelské grantové projekty (2003-2012) |
| Kategorie VaV | ZV - Základní výzkum |
| Hlavní obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Vedlejší obor | EA - Morfologické obory a cytologie |
| Zahájení řešení | 1.1.2006 |
| Ukončení řešení | 31.12.2008 |
| Datum posledního uvolnění účelové podpory | 21.2.2008 |
| Číslo smlouvy | KJB601630606 |
| Poslední stav řešení | U - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení |
| Finance projektu | |
| Období | 2006 | 2007 | 2008 | celkem |
|---|
| Výše podpory ze státního rozpočtu | 633 tis. Kč | 553 tis. Kč | 553 tis. Kč | 1 739 tis. Kč |
| Celkové uznané náklady | 633 tis. Kč | 553 tis. Kč | 553 tis. Kč | 1 739 tis. Kč |
| Typ | skutečně čerpané | skutečně čerpané | skutečně čerpané |
|
| Druh soutěže | VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji |
| Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích | SAV02006-B - Veřejná soutěž (AV0/KJ) |
| Cíle řešení v původním jazyce | Evoluční přestavby karyotypu mohou být rekonstruovány pomocí komparativního chromosomálního paintingu (KCP). Metoda KCP je založena na vizualizaci homeologických chromosomálních úseků/celých chromosomů sdílených dvěmi nebo více druhy. U rostlin je tato technika aplikovatelná jen u zastupců čeledi brukvovitých (Brassicaceae). Navrhovaný projekt si klade za cíl vytvořit nezbytné technické a metodologické zázemí pro širší aplikaci KCP v rámci Brassicaceae. KCP s použitím DNA sond pro všechny chromosomy huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana) umožní identifikovat homeologické chromosomy u dalších druhů. Navrhované experimenty dovolí specifikovat chromosomální změny zodpovědné za rozdílné chromosomové počty a definovat ancestrální a odvozené karyotypy. Porovnání chromosomálních a molekulárně-fylogenetických dat poskytne jedinečné informace o obecných trendech a časové struktuře evoluce karyotypu brukovitých, stejně jako o roli chromosomálních přestaveb při vzniku rostlinných druhů. |
| Klíčová slova v anglickém jazyce | comparative chromosome painting; Arabidopsis; Brassicaceae; crucifers; karyotype and chromosome evolution; genome colinearity; BAC; multicolour FISH; plant molecular phylogenetics and systematics; plant phylogenomics |
| Hodnocení výsledků | V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory. |
| Zhodnocení výsledků řešení česky | Byla vytvořena infrastruktura pro komparativní chromosomální painting v čeledi Brassicaceae, rekonstruována evoluce karyotypu a velikosti genomu u několika skupin brukvovitých, navržen koncept 2 ancestrálních karyotypů (ACK a PCK) v čeledi brukvovitých. |
| Rok dodání údajů do CEP | 2009 |
| Systémové označení dodávky dat | CEP09-AV0-KJ-U/02:2 |
| Datum dodání záznamu | 7.10.2009 |
| Účastníci projektu |
| Počet příjemců | 1 |
| Počet dalších účastníků projektu | 0 |
| Příjemce / Organizační jednotka garantující řešení | Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta |
| Řešitel | Mgr. Martin Lysák, PhD. (státní příslušnost: CZ - Česká republika; tel.: 549 494 154; fax: 541211214) |
| Finance účastníků projektu |
| Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007 |
| Výše podpory ze státního rozpočtu | |
| Účastník | 2007 | 2008 |
|---|
| Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta | 553 tis. Kč | 553 tis. Kč |
|
| Celkové uznané náklady | |
| Účastník | 2007 | 2008 |
|---|
| Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta | 553 tis. Kč | 553 tis. Kč |
|
| Výsledky projektu v RIV |
| Počet výsledků v RIV | 18 |
| Výsledek druhu C | RIV/00216224:14740/11:00049463 - Phylogeny, Genome, and Karyotype Evolution of Crucifers (Brassicaceae) (2011) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216224:14310/09:00028752 - A bicontinental origin of polyploid Australian/New Zealand Lepidium species (Brassicaceae)? Evidence from genomic in situ hybridization (2009) |
| Výsledek druhu C | RIV/00216224:14310/09:00028531 - Comparative Cytogenetics of Wild Crucifers (2009) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216224:14310/09:00028447 - The dynamic ups and downs of genome size evolution in Brassicaceae (2009) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216224:14310/08:00024401 - Chromosomal phylogeny and karyotype evolution in x=7 crucifer species (Brassicaceae) (2008) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216224:14310/07:00019484 - Ancestral Chromosomal Blocks Are Triplicated in Brassiceae Species with Varying Chromosome Number and Genome Size (2007) |
| Výsledek druhu O | RIV/00216224:14310/07:00019412 - Evolutionary and comparative cytogenetics of the Brassicaceae and Cleomaceae (2007) |
| Výsledek druhu O | RIV/00216224:14310/07:00019575 - Karyotype evolution in n=7 species from different tribes of the mustard family (Brassicaceae) (2007) |
| Výsledek druhu D | RIV/00216224:14310/07:00019575 - Karyotype evolution in n=7 species from different tribes of the mustard family (Brassicaceae) (2007) |
| Výsledek druhu O | RIV/00216224:14310/07:00019413 - New insights into comparative phylogenomics of crucifers (Brassicaceae). (2007) |
| Výsledek druhu O | RIV/00216224:14310/07:00019411 - Paleopolyploidy And Karyotype Evolution In Crucifers (Brassicaceae) (2007) |
| Výsledek druhu O | RIV/00216224:14310/07:00019628 - Punctuated genome size evolution in Liliaceae (2007) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216224:14310/07:00019410 - Supernetwork identifies multiple events of plastid trnF(GAA) pseudogene evolution in the Brassicaceae (2007) |
| Výsledek druhu D | RIV/00216224:14310/07:00019576 - Unexpected paleopolyploid evolution in Stenopetalum - a genus with the lowest chromosome numbers in the Brassicaceae (2007) |
| Výsledek druhu D | RIV/00216224:14310/07:00019574 - Unexpected paleopolyploid evolution in Stenopetalum - a genus with the lowest chromosome numbers in the Brassicaceae (2007) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216224:14310/06:00015496 - The ABC’s of comparative genomics in the Brassicaceae: building blocks of crucifer genomes (2006) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216224:14310/06:00015497 - Chromosome arrangement and nuclear architecture but not centromeric sequences are conserved between Arabidopsis thaliana and Arabidopsis lyrata (2006) |
| Výsledek druhu O | RIV/00216224:14310/06:00015498 - Diving deeper into the crucifer genomes (2006) |