• česky
  • english

KJB601630606 - Evoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae) (2006-2008, AV0/KJ)

Údaje o projektu
Identifikační kódKJB601630606
Důvěrnost údajůS - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
Název v původním jazyceEvoluce karyotypu brukvovitých rostlin (Brassicaceae)
PoskytovatelAV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR)
ProgramKJ - Juniorské badatelské grantové projekty (2003-2012)
Kategorie VaVZV - Základní výzkum
Hlavní oborEB - Genetika a molekulární biologie
Vedlejší oborEA - Morfologické obory a cytologie
Zahájení řešení1.1.2006
Ukončení řešení31.12.2008
Datum posledního uvolnění účelové podpory21.2.2008
Číslo smlouvyKJB601630606
Poslední stav řešeníU - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení
Finance projektu
Období200620072008celkem
Výše podpory ze státního rozpočtu633 tis. Kč553 tis. Kč553 tis. Kč1 739 tis. Kč
Celkové uznané náklady633 tis. Kč553 tis. Kč553 tis. Kč1 739 tis. Kč
Typskutečně čerpanéskutečně čerpanéskutečně čerpané
Druh soutěžeVS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacíchSAV02006-B - Veřejná soutěž (AV0/KJ)
Cíle řešení v původním jazyceEvoluční přestavby karyotypu mohou být rekonstruovány pomocí komparativního chromosomálního paintingu (KCP). Metoda KCP je založena na vizualizaci homeologických chromosomálních úseků/celých chromosomů sdílených dvěmi nebo více druhy. U rostlin je tato technika aplikovatelná jen u zastupců čeledi brukvovitých (Brassicaceae). Navrhovaný projekt si klade za cíl vytvořit nezbytné technické a metodologické zázemí pro širší aplikaci KCP v rámci Brassicaceae. KCP s použitím DNA sond pro všechny chromosomy huseníčku rolního (Arabidopsis thaliana) umožní identifikovat homeologické chromosomy u dalších druhů. Navrhované experimenty dovolí specifikovat chromosomální změny zodpovědné za rozdílné chromosomové počty a definovat ancestrální a odvozené karyotypy. Porovnání chromosomálních a molekulárně-fylogenetických dat poskytne jedinečné informace o obecných trendech a časové struktuře evoluce karyotypu brukovitých, stejně jako o roli chromosomálních přestaveb při vzniku rostlinných druhů.
Klíčová slova v anglickém jazycecomparative chromosome painting; Arabidopsis; Brassicaceae; crucifers; karyotype and chromosome evolution; genome colinearity; BAC; multicolour FISH; plant molecular phylogenetics and systematics; plant phylogenomics
Hodnocení výsledkůV - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
Zhodnocení výsledků řešení českyByla vytvořena infrastruktura pro komparativní chromosomální painting v čeledi Brassicaceae, rekonstruována evoluce karyotypu a velikosti genomu u několika skupin brukvovitých, navržen koncept 2 ancestrálních karyotypů (ACK a PCK) v čeledi brukvovitých.
Rok dodání údajů do CEP2009
Systémové označení dodávky datCEP09-AV0-KJ-U/02:2
Datum dodání záznamu7.10.2009
Účastníci projektu
Počet příjemců1
Počet dalších účastníků projektu0
Příjemce / Organizační jednotka garantující řešeníMasarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
ŘešitelMgr. Martin Lysák, PhD. (státní příslušnost: CZ - Česká republika; tel.: 549 494 154; fax: 541211214)
Finance účastníků projektu
Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007
Výše podpory ze státního rozpočtu
Účastník20072008
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta553 tis. Kč553 tis. Kč
Celkové uznané náklady
Účastník20072008
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta553 tis. Kč553 tis. Kč
Výsledky projektu v RIV
Počet výsledků v RIV18
Výsledek druhu CRIV/00216224:14740/11:00049463 - Phylogeny, Genome, and Karyotype Evolution of Crucifers (Brassicaceae) (2011)
Výsledek druhu JRIV/00216224:14310/09:00028752 - A bicontinental origin of polyploid Australian/New Zealand Lepidium species (Brassicaceae)? Evidence from genomic in situ hybridization (2009)
Výsledek druhu CRIV/00216224:14310/09:00028531 - Comparative Cytogenetics of Wild Crucifers (2009)
Výsledek druhu JRIV/00216224:14310/09:00028447 - The dynamic ups and downs of genome size evolution in Brassicaceae (2009)
Výsledek druhu JRIV/00216224:14310/08:00024401 - Chromosomal phylogeny and karyotype evolution in x=7 crucifer species (Brassicaceae) (2008)
Výsledek druhu JRIV/00216224:14310/07:00019484 - Ancestral Chromosomal Blocks Are Triplicated in Brassiceae Species with Varying Chromosome Number and Genome Size (2007)
Výsledek druhu ORIV/00216224:14310/07:00019412 - Evolutionary and comparative cytogenetics of the Brassicaceae and Cleomaceae (2007)
Výsledek druhu ORIV/00216224:14310/07:00019575 - Karyotype evolution in n=7 species from different tribes of the mustard family (Brassicaceae) (2007)
Výsledek druhu DRIV/00216224:14310/07:00019575 - Karyotype evolution in n=7 species from different tribes of the mustard family (Brassicaceae) (2007)
Výsledek druhu ORIV/00216224:14310/07:00019413 - New insights into comparative phylogenomics of crucifers (Brassicaceae). (2007)
Výsledek druhu ORIV/00216224:14310/07:00019411 - Paleopolyploidy And Karyotype Evolution In Crucifers (Brassicaceae) (2007)
Výsledek druhu ORIV/00216224:14310/07:00019628 - Punctuated genome size evolution in Liliaceae (2007)
Výsledek druhu JRIV/00216224:14310/07:00019410 - Supernetwork identifies multiple events of plastid trnF(GAA) pseudogene evolution in the Brassicaceae (2007)
Výsledek druhu DRIV/00216224:14310/07:00019576 - Unexpected paleopolyploid evolution in Stenopetalum - a genus with the lowest chromosome numbers in the Brassicaceae (2007)
Výsledek druhu DRIV/00216224:14310/07:00019574 - Unexpected paleopolyploid evolution in Stenopetalum - a genus with the lowest chromosome numbers in the Brassicaceae (2007)
Výsledek druhu JRIV/00216224:14310/06:00015496 - The ABC’s of comparative genomics in the Brassicaceae: building blocks of crucifer genomes (2006)
Výsledek druhu JRIV/00216224:14310/06:00015497 - Chromosome arrangement and nuclear architecture but not centromeric sequences are conserved between Arabidopsis thaliana and Arabidopsis lyrata (2006)
Výsledek druhu ORIV/00216224:14310/06:00015498 - Diving deeper into the crucifer genomes (2006)