| | |
|---|
| Údaje o projektu |
| Identifikační kód | KJB101120805 |
| Důvěrnost údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Název v původním jazyce | Nové přístupy ke studiu struktury proteinů pomocí vibrační spektroskopie |
| Poskytovatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR) |
| Program | KJ - Juniorské badatelské grantové projekty (2003-2012) |
| Kategorie VaV | ZV - Základní výzkum |
| Hlavní obor | BO - Biofyzika |
| Vedlejší obor | CE - Biochemie |
| Zahájení řešení | 1.1.2008 |
| Ukončení řešení | 31.12.2010 |
| Datum posledního uvolnění účelové podpory | 9.3.2010 |
| Číslo smlouvy | KJB101120805 |
| Poslední stav řešení | U - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení |
| Finance projektu | |
| Období | 2008 | 2009 | 2010 | celkem |
|---|
| Výše podpory ze státního rozpočtu | 546 tis. Kč | 546 tis. Kč | 530 tis. Kč | 1 622 tis. Kč |
| Celkové uznané náklady | 546 tis. Kč | 546 tis. Kč | 530 tis. Kč | 1 622 tis. Kč |
| Typ | skutečně čerpané | skutečně čerpané | skutečně čerpané |
|
| Druh soutěže | VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji |
| Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích | SAV02008-B - Veřejná soutěž (AV0/KJ) |
| Cíle řešení v původním jazyce | Určení struktury proteinů představuje jednu z klíčových úloh současné molekulární biologie. Je zde naléhavá potřeba třídimenzionálních struktur proteinů pro pochopení jejich role v organizmech a pro efektivní návrh léčiv. Hlavním cílem projektu je vývoj nové metodiky pro stanovení obsahu sekundárních struktur proteinů pomocí vibrační spektroskopie (Ramanova spektroskopie, Ramanova optická aktivita, Ramanova spektroskopie kapkově nanášených povlaků, Fourierova infračervená spektroskopie, Fourierova infračervená spektroskopie se zeslabenou totální reflexí). Pro každou metodu bude změřena nová rozsáhlá spektrální referenční sada, budou implementovány stávají metody a nové metody (založené na multivariační statistice) s vyšším informačním obsahem, např. určením počtu strukturních segmentů, či sbalení atd. Vyvinuté metody budou volně k dispozici a mohou být aplikovány v dalším proteinovém výzkumu. |
| Klíčová slova v anglickém jazyce | vibrational spectroscopy; Raman spectroscopy; Raman optical activity; infrared spectroscopy; protein structure; secondary structure; data analysis; chemometrics |
| Hodnocení výsledků | U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory |
| Zhodnocení výsledků řešení česky | Byly vytvořeny nové přístupy pro studium struktury proteinů v roztocích, skelných depozitech a krystalech pomocí vibrační spektroskopie; rovněž pro stanovení koncentrace proteinů Ramanovou spektroskopií. Užití metod s důrazem na DCDR bylo demonstrováno. |
| Rok dodání údajů do CEP | 2011 |
| Systémové označení dodávky dat | CEP11-AV0-KJ-U/02:2 |
| Datum dodání záznamu | 14.6.2011 |
| Účastníci projektu |
| Počet příjemců | 2 |
| Počet dalších účastníků projektu | 0 |
| Koordinující příjemce / Organizační jednotka garantující řešení | Univerzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta |
| Řešitel | RNDr. Vladimír Kopecký, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika; tel.: +420 221 911 472; fax: +420 224 922 797) |
| Příjemce | Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Řešitel | RNDr. Kateřina Hofbauerová, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika; tel.: +420241062147; fax: +420244471286) |
| Finance účastníků projektu |
| Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007 |
| Výše podpory ze státního rozpočtu | |
| Účastník | 2008 | 2009 | 2010 |
|---|
| Univerzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta | 316 tis. Kč | 316 tis. Kč | 310 tis. Kč |
| Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. | 230 tis. Kč | 230 tis. Kč | 220 tis. Kč |
|
| Celkové uznané náklady | |
| Účastník | 2008 | 2009 | 2010 |
|---|
| Univerzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta | 316 tis. Kč | 316 tis. Kč | 310 tis. Kč |
| Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. | 230 tis. Kč | 230 tis. Kč | 220 tis. Kč |
|
| Výsledky projektu v RIV |
| Počet výsledků v RIV | 8 |
| Výsledek druhu J | RIV/00216208:11310/12:10126859 - Mouse Clr-g, a Ligand for NK Cell Activation Receptor NKR-P1F: Crystal Structure and Biophysical Properties (2012) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216208:11320/12:10125573 - Raman spectroscopy adds complementary detail to the high-resolution x-ray crystal structure of photosynthetic PsbP from Spinacia oleracea (2012) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216208:11320/12:10125473 - Structural changes of human RNase L upon homodimerization investigated by Raman spectroscopy (2012) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388971:_____/11:00363604 - Molecular architecture of mouse activating NKR-P1 receptors (2011) |
| Výsledek druhu J | RIV/67179843:_____/11:00371075 - Structural analysis of natural killer cell receptor protein 1 (NKR-P1) extracellular domains suggests a conserved long loop region involved in ligand specificity (2011) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216208:11320/11:10099136 - Tajemství kávových kapek aneb nová metoda pro Ramanovu spektroskopii biomolekul (2011) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216208:11320/09:00206775 - Structural analysis of the extrinsic PsbP protein of PSII from Spinacea oleracea by X-ray crystallography, Raman spectrosocpy and bioinformatics (2009) |
| Výsledek druhu D | RIV/00216208:11320/08:00100585 - Raman and infrared spectroscopy of amino acids and improvement of protein secondary structure determination (2008) |
nebo telefonním čísle 224 234 797 (v pracovních dnech 8-16 hod.).