| | |
|---|
| Údaje o projektu |
| Identifikační kód | IAA5052706 |
| Důvěrnost údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Název v původním jazyce | Sekvenace DNA bovinního herpesviru-1 (účast v mezinárodním genomovém projektu) |
| Poskytovatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR) |
| Program | IA - Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR (1991-2013) |
| Hlavní obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Zahájení řešení | 01/1997 |
| Ukončení řešení | 12/1999 |
| Poslední stav řešení | U - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení |
| Finance projektu | |
| Období | 1997 | 1998 | 1999 | celkem |
|---|
| Výše podpory ze státního rozpočtu | 314 tis. Kč | 272 tis. Kč | 263 tis. Kč | 849 tis. Kč |
| Celkové uznané náklady | 396 tis. Kč | 272 tis. Kč | 604 tis. Kč | 1 272 tis. Kč |
| Typ | skutečně čerpané | skutečně čerpané | skutečně čerpané |
|
| Cíle řešení v původním jazyce | Navrhuje se účast v mezinárodním genomovém projektu s cílem stanovit úplnou nukleotidovou sekvenci genomu bovinního herpesviru 1 (BHV-1). BHV-1 je pathogen vyvolávající infekční rhinotracheitis s vážnými ekonomickými dopady. Genomový projekt je koordinován univerzitou v Zurichu a zůčastňuje se ho 15 laboratoří.DNA viru je bohatá na páry GC (74%), což činí sekvenaci obtížnou. Konstruovali jsme specializované vektory a vypracovali strategii pro sekvenaci DNA s extrémním složením bazí. Podmínky pro naši úspěšnou účast v tomto projektu jsou proto dobré. Selektované oblasti DNA budou parciálně štěpen restrikčním enzymeme HinPI a fragmenty budou klonovány s vektorem M13 linearizovaným AccI. Kontigy budou sestavovány pomocí programů GeneSkipper. |
| Hodnocení výsledků | U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory |
| Zhodnocení výsledků řešení česky | Byl dokončen mezinár. gen. projekt "Genom bovinního herpesviru-1". V sekvenované DNA jsme identifikovali 71 genů a regulační elementy, které řídí expresi těchto genů. Ze všech zúč. laboratoří jsme k projektu přispěli nejvíce. |
| Rok dodání údajů do CEP | 2000 |
| Systémové označení dodávky dat | CEP/2000/AV0/AV00IA/U/6:3 |
| Účastníci projektu |
| Počet příjemců | 1 |
| Počet dalších účastníků projektu | 0 |
| Příjemce | Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. |
| Řešitel | Prof. RNDr. Václav Pačes, DrSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007 |
| Výsledky projektu v RIV |
| Počet výsledků v RIV | 2 |
| Výsledek druhu J | RIV/68378050:_____/99:23990218 - Genomics for Biotechnology. (1999) |
| Výsledek druhu J | RIV/68378050:_____/99:23990174 - Genomics on the Eve of the 21th Century. (1999) |