• česky
  • english

IAA5052706 - Sekvenace DNA bovinního herpesviru-1 (účast v mezinárodním genomovém projektu) (1997-1999, AV0/IA)

Údaje o projektu
Identifikační kódIAA5052706
Důvěrnost údajůS - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
Název v původním jazyceSekvenace DNA bovinního herpesviru-1 (účast v mezinárodním genomovém projektu)
PoskytovatelAV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR)
ProgramIA - Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR (1991-2013)
Hlavní oborEB - Genetika a molekulární biologie
Zahájení řešení01/1997
Ukončení řešení12/1999
Poslední stav řešeníU - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení
Finance projektu
Období199719981999celkem
Výše podpory ze státního rozpočtu314 tis. Kč272 tis. Kč263 tis. Kč849 tis. Kč
Celkové uznané náklady396 tis. Kč272 tis. Kč604 tis. Kč1 272 tis. Kč
Typskutečně čerpanéskutečně čerpanéskutečně čerpané
Cíle řešení v původním jazyceNavrhuje se účast v mezinárodním genomovém projektu s cílem stanovit úplnou nukleotidovou sekvenci genomu bovinního herpesviru 1 (BHV-1). BHV-1 je pathogen vyvolávající infekční rhinotracheitis s vážnými ekonomickými dopady. Genomový projekt je koordinován univerzitou v Zurichu a zůčastňuje se ho 15 laboratoří.DNA viru je bohatá na páry GC (74%), což činí sekvenaci obtížnou. Konstruovali jsme specializované vektory a vypracovali strategii pro sekvenaci DNA s extrémním složením bazí. Podmínky pro naši úspěšnou účast v tomto projektu jsou proto dobré. Selektované oblasti DNA budou parciálně štěpen restrikčním enzymeme HinPI a fragmenty budou klonovány s vektorem M13 linearizovaným AccI. Kontigy budou sestavovány pomocí programů GeneSkipper.
Hodnocení výsledkůU - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
Zhodnocení výsledků řešení českyByl dokončen mezinár. gen. projekt "Genom bovinního herpesviru-1". V sekvenované DNA jsme identifikovali 71 genů a regulační elementy, které řídí expresi těchto genů. Ze všech zúč. laboratoří jsme k projektu přispěli nejvíce.
Rok dodání údajů do CEP2000
Systémové označení dodávky datCEP/2000/AV0/AV00IA/U/6:3
Účastníci projektu
Počet příjemců1
Počet dalších účastníků projektu0
PříjemceÚstav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
ŘešitelProf. RNDr. Václav Pačes, DrSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007
Výsledky projektu v RIV
Počet výsledků v RIV2
Výsledek druhu JRIV/68378050:_____/99:23990218 - Genomics for Biotechnology. (1999)
Výsledek druhu JRIV/68378050:_____/99:23990174 - Genomics on the Eve of the 21th Century. (1999)