| | |
|---|
| Údaje o projektu |
| Identifikační kód | IAA5052206 |
| Důvěrnost údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Název v původním jazyce | Gen ybxF, nově identifikovaný člen streptomycinového operonu u Bacillus subtilis |
| Poskytovatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR) |
| Program | IA - Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR (1991-2013) |
| Kategorie VaV | ZV - Základní výzkum |
| Hlavní obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Vedlejší obor | EE - Mikrobiologie, virologie |
| Zahájení řešení | 01/2002 |
| Ukončení řešení | 12/2005 |
| Zahájení poskytování účelové podpory | 02/2002 |
| Ukončení poskytování účelové podpory | 02/2005 |
| Poslední stav řešení | U - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení |
| Finance projektu | |
| Období | 2002 | 2003 | 2004 | 2005 | celkem |
|---|
| Výše podpory ze státního rozpočtu | 558 tis. Kč | 589 tis. Kč | 582 tis. Kč | 598 tis. Kč | 2 327 tis. Kč |
| Celkové uznané náklady | 828 tis. Kč | 886 tis. Kč | 909 tis. Kč | 958 tis. Kč | 3 581 tis. Kč |
| Typ | skutečně čerpané | skutečně čerpané | skutečně čerpané | skutečně čerpané |
|
| Druh soutěže | VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji |
| Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích | SAV02002-AB - Veřejná soutěž (AV0/IA) |
| Cíle řešení v původním jazyce | Streptomycinový (str) operon, jeden z nejvíce evolučně konservovaných operonů u prokaryotů, se u E. coli skládá ze čtyř "house-keeping" genů: rpsL, rpsG, fus a tufA. První dva geny kodují ribosomální bílkoviny S12 a S7, druhé dva elongační faktory EF-G a EF-Tu. Nedávno jsme prokázali, že str operon gram-positivníchj bakterií B. stearothermophilus a b. subtilis, nese na svém 5'konci ještě další gen, nazvaný ybxF. Jeho transkripce ovlivňuje expresi zbylých čtyř genů operonu. ybxF koduje v obou organismech protein s dosud neznámou funkcí a podle údajů v databasích je tento gen přítgomen i v dalších gram-positivních bakteriích. Zcela ale chybí v bakteriích gram-negativních. V projektu se navrhuje provedení komplexní studie ybxF: 1) Bude připraven a charakterizován B. subtilis bez genu ybxF (ybxF knoc-out), 2) Budou určeny důsledky zvýšené produkce proteinu abxF pro transkripci a buňku, 3) Protein ybxF bude isolován, testován a krystalizován k určení 3D struktury. |
| Klíčová slova v anglickém jazyce | Bacillus subtilis; str operon; ybx F gene; ybx F protein function |
| Hodnocení výsledků | N - Nesplněno zadání, tj. nebyly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory |
| Zhodnocení výsledků řešení česky | První gen streptomycinového operonu Bacillus subtilis, nazvaný ybxF, je neesenciálním genem kodujícím malou ribosomální bílkovinu o 82 aminokyselinách. Protein GreA inhibuje aktivitu RNA polymerázy B. subtilis při iniciaci z rrn promotorů in vitro. |
| Rok dodání údajů do CEP | 2006 |
| Systémové označení dodávky dat | CEP06-AV0-IA-U/04:2 |
| Datum dodání záznamu | 26.9.2007 |
| Účastníci projektu |
| Počet příjemců | 1 |
| Počet dalších účastníků projektu | 0 |
| Příjemce | Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. |
| Řešitel | Doc. MUDr. Jiří Jonák, DrSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika; tel.: 220183111; fax: 224310955) |
| Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007 |
| Výsledky projektu v RIV |
| Počet výsledků v RIV | 3 |
| Výsledek druhu J | RIV/68378050:_____/07:00097160 - Bacterial elongation factors EF-Tu, their mutants, chimeric forms, and domains: isolation and purification (2007) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216208:11110/07:00009095 - YbxF, a protein associated with exponential-phase ribosomes in Bacillus subtilis (2007) |
| Výsledek druhu D | RIV/68378050:_____/03:23033198 - Thermostability of Multidomain Proteins Studied by Domain Swapping between Mesophilic-Escherichia coli and Thermophilic-Bacillus stearothermophilus Elongation Factors EF-Tu. (2003) |
nebo telefonním čísle 224 234 797 (v pracovních dnech 8-16 hod.).