• česky
  • english

IAA400550702 - Spektroskopické a teoretické metody pro studium nekovaletních molekulových interakcí (2007-2010, AV0/IA)

Údaje o projektu
Identifikační kódIAA400550702
Důvěrnost údajůS - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
Název v původním jazyceSpektroskopické a teoretické metody pro studium nekovaletních molekulových interakcí
PoskytovatelAV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR)
ProgramIA - Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR (1991-2013)
Kategorie VaVZV - Základní výzkum
Hlavní oborCF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Vedlejší oborBO - Biofyzika
Zahájení řešení1.1.2007
Ukončení řešení31.12.2010
Datum posledního uvolnění účelové podpory9.3.2010
Číslo smlouvyIAA400550702
Poslední stav řešeníU - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení
Finance projektu
Období2007200820092010celkem
Výše podpory ze státního rozpočtu1 277 tis. Kč1 277 tis. Kč1 277 tis. Kč1 277 tis. Kč5 108 tis. Kč
Celkové uznané náklady1 277 tis. Kč1 277 tis. Kč1 277 tis. Kč1 277 tis. Kč5 108 tis. Kč
Typskutečně čerpanéskutečně čerpanéskutečně čerpanéskutečně čerpané
Druh soutěžeVS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacíchSAV02007-A - Veřejná soutěž (AV0/IA)
Cíle řešení v původním jazyceBudou vyvinuty experimentální a teoretické postupy pro molekulární modelování a interpretaci spekter, které umožní lépe porozumět chování molekul ve vybraných oblastech organické chemie a molekulární biologie. Výpočetní metody budou založeny na kombinaci klasických a kvantových metod. Aplikace zahrnují určení vztahu mezi flexibilitou a reaktivitou nových cukerných derivátů, strukturní studie nanomolekulárních komplexů peptidů a porfyrinů s potenciálním využitím v lékařství, peptidů prionového typu a komplexy nukleových kyselin s anti-rakovinnými léčivy. Projekt využívá výhody mnoha technik a kombinuje zkušenosti pracovníku Vysoké školy chemicko-technologické, Karlovy Univerzity a Ústavu organické chemie a biochemie. Předpokládá se i spolupráce s První lékařskou fakultou v Praze a zahraničními laboratořemi. Do projektu bude zapojeno 11 studentů.
Klíčová slova v anglickém jazycemolecular modeling; vibrational spectra; nuclear magnetic resonance; optical activity; ab initio; quantum mechanics; molecular dynamics; porphyrins, saccharides; nucleic acids
Hodnocení výsledkůV - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
Zhodnocení výsledků řešení českyProjekt přinesl 45 impaktovaných publikací, počítačové programy, a 4 PhD. práce. Hlavním výsledkem jsou nové chirální metody, experimentální a teoretické postupy, použitelné v strukturních studiích. V projektu se osvědčila účast více pracovišť.
Rok dodání údajů do CEP2011
Systémové označení dodávky datCEP11-AV0-IA-U/01:1
Datum dodání záznamu20.5.2011
Účastníci projektu
Počet příjemců3
Počet dalších účastníků projektu0
Koordinující příjemceÚstav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
ŘešitelRNDr. Petr Bouř, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika; tel.: 220183348; fax: 220183583)
Příjemce / Organizační jednotka garantující řešeníUniverzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta
ŘešitelDoc. RNDr. Vladimír Baumruk, DrSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika; tel.: 221911473; fax: 224922797)
Příjemce / Organizační jednotka garantující řešeníVysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemicko-inženýrská
ŘešitelDoc. RNDr. Marie Urbanová, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika; tel.: 22044 3036; fax: 22044 4334)
Finance účastníků projektu
Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007
Výše podpory ze státního rozpočtu
Účastník2007200820092010
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.760 tis. Kč760 tis. Kč760 tis. Kč760 tis. Kč
Univerzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta227 tis. Kč227 tis. Kč227 tis. Kč227 tis. Kč
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemicko-inženýrská290 tis. Kč290 tis. Kč290 tis. Kč290 tis. Kč
Celkové uznané náklady
Účastník2007200820092010
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.760 tis. Kč760 tis. Kč760 tis. Kč760 tis. Kč
Univerzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta227 tis. Kč227 tis. Kč227 tis. Kč227 tis. Kč
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemicko-inženýrská290 tis. Kč290 tis. Kč290 tis. Kč290 tis. Kč
Výsledky projektu v RIV
Počet výsledků v RIV56
Výsledek druhu CRIV/68378050:_____/11:00361112 - Carbohydrate-Containing Dendrimers in Biomedical Applications (2011)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/11:00360474 - Monitoring the Backbone Conformation of Valinomycin by Raman Optical Activity (2011)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/11:00359011 - Simulations of the Temperature Dependence of Amide I Vibration (2011)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/11:43881492 - Study of Stereoselective Interactions of Carbamoylated Quinine and Quinidine with 3,5-Dinitrobenzoyl alpha-Amino Acids Using VCD Spectroscopy in the Region of C-H Stretching Vibrations (2011)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/11:00359110 - Theoretical Modeling of Peptide .alpha.-Helical Circular Dichroism in Aqueous Solution (2011)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00345973 - A Fourier Transform Method for Generation of Anharmonic Vibrational Molecular Spectra (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00348930 - A spectroscopic method to estimate the binding potency of amphiphile assemblies (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00352921 - Applications of the Cartesian Coordinate Tensor Transfer Technique in the Simulations of Vibrational Circular Dichroism Spectra of Oligonucleotides (2010)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/10:00023390 - Association of biotin with silver (I) in solution: a circular dichroism study (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00342468 - Computational analysis of solvent effects in NMR spectroscopy (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00343973 - Conformational Behavior of Simple Furanosides Studied by Optical Rotation (2010)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/10:00023391 - Enantioselective interaction of carbamoylated quinine and (S)-3,5-dinitrobenzoyl alanine: theoretical and experimental circular dichroism study (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00348939 - Formation and structure of the potassium complex of valinomycin in solution studied by Raman optical activity spectroscopy (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00343343 - Intramolecular Proton Transfer in Calixphyrin Derivatives (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00345980 - Side Chain and Flexibility Contributions to the Raman Optical Activity Spectra of a Model Cyclic Hexapeptide (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00342445 - Rearrangement of Dewar Benzene Derivatives Studied by DFT (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00342841 - Theoretical Modeling of Magnesium Ion Imprints in the Raman Scattering of Water (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00342839 - Theoretical Study of Vibrationally Averaged Dipole Moments for the Ground and Excited C=O Stretching States of trans-Formic Acid (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00346353 - Transferability of anharmonic force fields in simulations of molecular vibrations (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/10:00343108 - Vibrational and Electronic optical Activity of the Chiral Disulphide Group: Implications for Disulphide Bridge Conformation (2010)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00326805 - Infrared absorption detection of metal ion-deoxyguanosine monophosphate binding: Experimental and theoretical study (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00326850 - Interpretation of Raman and Raman Optical Activity Spectra of a Flexible Sugar Derivative, the Gluconic Acid Anion (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00326855 - L-Alanyl-L-alanine Conformational Changes Induced by pH As Monitored by the Raman Optical Activity Spectra (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00334402 - Modeling of a Tröger’s tweezer and its complexation properties (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00326798 - Molecular dynamics with restrictions derived from optical spectra (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00326802 - Relative importance of first and second derivatives of nuclear magnetic resonance chemical shifts and spin-spin coupling constants for vibrational averaging (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00326807 - Simulation of vibrational spectra of large molecules by arbitrary time propagation (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00332547 - Solvent dependence of the N-methylacetamide structure and force field (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00332605 - Structure of the Alanine Hydration Shell as Probed by NMR Chemical Shifts and Indirect Spin-Spin Coupling (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00338258 - TD-DFT Modeling of the Circular Dichroism for a Tryptophan Zipper Peptide with Coupled Aromatic Residues (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00324911 - Theoretical study of the effective chemical shielding anisotropy (CSA) in peptide backbone, rating the impact of CSAs on the cross-correlated relaxations in L-alanyl-L-alanine (2009)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/09:00021837 - Vibrational and electronic circular dichroism study of bile pigments: Complexes of bilirubin and biliverdin with metals (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/09:00338262 - Vibrational Raman Optical Activity of 1-Phenylethanol and 1-Phenylethylamine: Revisiting Old Friends (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00311257 - Ab initio modeling of the electronic circular dichroism induced in porphyrin chromophores (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00313823 - The accuracy of local MP2 methods for conformational energies (2008)
Výsledek druhu DRIV/60461373:22340/08:00020222 - Bilirubin and biliverdin: structural studies by electronic and vibrational circular dichroism (2008)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/08:00020210 - Chiral memory and self-replication study of porphyrin and bilirubin aggregates formed on polypeptide matrices (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00315658 - Circular Dichroism Enhancement in Large DNA Aggregates Simulated by a generalized oscillator model (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00312547 - Comparison of quantitative conformer analyses by nuclear magnetic resonance and raman optical activity spectra for model dipeptides (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00306283 - Conformational properties of the Pro-Gly motif in the D-Ala-L-Pro-Gly-D-Ala model peptide explored by a statistical analysis of the NMR, Raman, and Raman optical activity spectra (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00311279 - Dependence ofthe L-alanyl-L-alanine conformation on molecular charge determined from ab initio computations and NMR spectra (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00316599 - Dynamics and magnetic resonance properties of Sc3C2@C80 and its monoanion (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00311289 - Molecular dynamics simulation of chiral chromatography (2008)
Výsledek druhu JRIV/67985858:_____/08:00313938 - Probing the flexibility of internal rotation in silylated phenols with the NMR scalar spin-spin coupling constants (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00315508 - Quasiplanarity of the peptide bond (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00312938 - Stereochemical preference of nucleophillic cleavage in methyl erythrofuranosides explained by density functional theory computations (2008)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/08:00020223 - Stereoselective bile pigment binding to polypeptides (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00315675 - Vibrational circulardichroism and IR spectral analysis as a test of theoretical conformational modeling for a cyclic hexapeptide (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/07:00087190 - Anharmonic effects in IR, Raman, and Raman optical activity spectra of alanine and proline zwitterions (2007)
Výsledek druhu JRIV/60461373:22340/07:00018103 - Bile pigment complexes with cyclodextrins: electronic and vibrational circular dichroism study (2007)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/07:00087176 - DNA oligonucleotide-cis-platin Binding: Ab initio interpretation of the vibrational spectra (2007)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/07:00087153 - Force field modeling of amino acid conformational energies (2007)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/07:00087242 - Interpretation of synchrotron radiation circular dichroism spectra of anionic, cationic, and zwitterionic dialanine forms (2007)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/07:00087266 - Matrix formulation of the surface-enhanced Raman optical activity theory (2007)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/07:00087183 - Simulations of vibrational spectra from classical trajectories: Calibration with ab initio force fields (2007)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/07:00086635 - Spectroscopic properties of the nonplanar amide group: A computational study (2007)