Přejít na obsah | Přejít na menu

GP206/08/P222 - Evoluce GC obsahu a genomu trav (2008-2010, GA0/GP)

Údaje o projektu

Identifikační kód

GP206/08/P222

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název v původním jazyce

Evoluce GC obsahu a genomu trav

Poskytovatel

GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)

Program

GP - Postdoktorandské granty (1998-…)

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

Hlavní obor

EF - Botanika

Zahájení řešení

1.1.2008

Ukončení řešení

31.12.2010

Datum posledního uvolnění účelové podpory

16.4.2010

Číslo smlouvy

206/08/P222

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení

Finance projektu

Období	2008	2009	2010	celkem
Výše podpory ze státního rozpočtu	762 tis. Kč	795 tis. Kč	627 tis. Kč	2 184 tis. Kč
Celkové uznané náklady	762 tis. Kč	795 tis. Kč	627 tis. Kč	2 184 tis. Kč
Typ	skutečně čerpané	skutečně čerpané	skutečně čerpané

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji

Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích

SGA02008GA1PD - Veřejná soutěž (GA0/GP)

Cíle řešení v původním jazyce

Záměrem tohoto projektu je mapovat změny v obsahu GC bazí (guaninu a cytosinu) související s fylogenezí druhů a globální evolucí genomu. Studium bude zaměřeno na modelovou čeleď Poaceae, vyznačující se nejvyšším a nejvariabilnějším GC obsahem v rámci vyšších rostlin, a bude postihovat všechny systematické úrovně, od rozdílů mezi čeleděmi, rody, druhy, až po vnitrodruhovou variabilitu. Dílčí studie jsou zaměřeny na: (i) sledování původu a následné evoluce vysokého GC obsahu genomu a genů trav v rámci jednoděložných, (ii) sledování rozdílů v GC obsahu a velikosti chromozomů mezi hlavními evolučními liniemi trav, (iii) testování evolučního významu vysokého obsahu GC a následně vyšší termostability DNA pro rostliny z extrémních klimatických podmínek, (iv) prověření souvislosti změn obsahu GC s evolucí genomu v důsledku expanze a redukce mobilních elementů (na mezidruhové úrovni v rodě Oryza, na vnitrodruhové u Festuca pallens), a (v) na ověření možného využití měření obsahu GC a velikosti genomu pro

Klíčová slova v anglickém jazyce

Poaceae; genome evolution; phylogeny; genome size; GC content; flow cytometry; LTR retrotransposons

Hodnocení výsledků

V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.

Zhodnocení výsledků řešení česky

V průběhu projektu byla naměřena velikost genomu a GC obsah u 770 druhů (72 z 81 čeledí jednoděložných; 350 z toho Poaceae a z nich 90 Oryza). Tento datový soubor je nejrozsáhlejší a fylogeneticky nejrobustnější přehled genomických parametrů u rostlin, umožnující relevantně testovat řadu hypotéz o evoluci genomu. Evolučně staré nárůsty v GC jsou nápadně asociovány s 

Rok dodání údajů do CEP

2011

Systémové označení dodávky dat

CEP11-GA0-GP-U/02:2

Datum dodání záznamu

22.12.2011

Účastníci projektu

Počet příjemců

Počet dalších účastníků projektu

Příjemce / Organizační jednotka garantující řešení

Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Řešitel