• česky
  • english
Přejít na obsah | Přejít na menu

Informační systém výzkumu, experimentálního vývoje a inovací
výzkum, vývoj a inovace podporované z veřejných prostředků ČR

    • Poskytovatelé podpory ve výzkumu, vývoji a inovacích (RPO)
    • Programy výzkumu, vývoje a inovací (RPG)
    • Subjekty ve výzkumu, vývoji a inovacích (RPR)
  • Veřejné soutěže ve výzkumu, vývoji a inovacích (VES)
  • Projekty výzkumu, vývoje a inovací (CEP)
  • Výzkumné záměry (CEZ)
  • Výsledky výzkumu, vývoje a inovací (RIV)

GP202/02/D114 - Molekulárně-dynamické simulace modifikovaných nukleových kyselin - potenciálních chemoterapeutik (2002-2005, GA0/GP)

Údaje o projektu
Identifikační kódGP202/02/D114
Důvěrnost údajůS - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
Název v původním jazyceMolekulárně-dynamické simulace modifikovaných nukleových kyselin - potenciálních chemoterapeutik
PoskytovatelGA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
ProgramGP - Postdoktorandské granty (1998-…)
Kategorie VaVZV - Základní výzkum
Hlavní oborBG - Jaderná, atomová a molekulová fyzika, urychlovače
Vedlejší oborCF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Další vedlejší oborCD - Makromolekulární chemie
Zahájení řešení09/2002
Ukončení řešení08/2005
Zahájení poskytování účelové podpory09/2002
Ukončení poskytování účelové podpory08/2005
Poslední stav řešeníU - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení
Finance projektu
Období2002200320042005celkem
Výše podpory ze státního rozpočtu77 tis. Kč231 tis. Kč231 tis. Kč154 tis. Kč693 tis. Kč
Celkové uznané náklady236 tis. Kč390 tis. Kč390 tis. Kč313 tis. Kč1 329 tis. Kč
Typskutečně čerpanéskutečně čerpanéskutečně čerpanéskutečně čerpané
Druh soutěžeVS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacíchSGA02002GA-PD - Veřejná soutěž (GA0/GP)
Cíle řešení v původním jazyceProjekt je zaměřen na studium vlivu chemické modifikace na strukturní a hybridizační vlastnosti syntetických analog nukleových kyselin. Hlavní pozornost bude věnována nalezení optimální modifikace vedoucí ke stabilizaci dvojšroubovicovitých atrojšroubovicovitých struktur prostřednictvím intervláknové interakce. Tento postdoktorandský projekt je přidružen k nosnému projektu v jehož rámci jsou připravována enzymaticky stabilní fosfonátová analoga nukleových kyselin. Nukleové kyseliny sezvýšenými schopnostmi hybridizace a stability vůči nukleázám jsou zajímavé z hlediska jejich využití jako potenciálních chemoterapeutik fungujících prostřednictvím "antisense" mechanismu (modifikované vlákno nukleové kyseliny se váže ke specifickésekvenci nukleotidů v mRNAa inhibuje tak tvorbu nějakého specifického proteinu). Metoda řešení bude založena na molekulárně-dynamických simulacích, které dovolují simulace při nenulové teplotě (typicky 300 K) s atomární reprezentací roztoku a iontů.
Klíčová slova v anglickém jazyceNeuvedeno.
Hodnocení výsledkůV - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
Zhodnocení výsledků řešení českyMolekulárně-dynamické simulace zodpověděly otázku, jakým způsobem mohou skupiny atomů s kladným nábojem stabilizovat dvojšroubovicovité a trojšroubovicovité struktury nukleových kyselin sestávající z přirozených či a-anomerických vláken nukleových kyseli
Rok dodání údajů do CEP2006
Systémové označení dodávky datCEP06-GA0-GP-U/06:6
Datum dodání záznamu19.5.2008
Účastníci projektu
Počet příjemců1
Počet dalších účastníků projektu0
Příjemce / Organizační jednotka garantující řešeníUniverzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta
ŘešitelRNDr. Ivan Barvík, Ph.D. (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007
Výsledky projektu v RIV
Počet výsledků v RIV7
Výsledek druhu JRIV/00216208:11320/06:00002284 - Impact of the Guanidium Group on Hybridization and Cellular Uptake of Cationic Oligonucleotides (2006)
Výsledek druhu JRIV/00216208:11320/05:00001160 - Cationic Phosphoramidate a-oligonucleotides Target Double Stranded DNA: Molecular Dynamics Study (2005)
Výsledek druhu JRIV/00216208:11320/05:00000763 - E. Coli RNase HI and the Phosphonate-DNA/RNA Hybrid: Molecular Dynamics Simulations (2005)
Výsledek druhu JRIV/00216208:11320/05:00001136 - The role of Calcium in the Conformational Dynamics and Thermal Stability of the D-Galactose/D-Glucose-Binding Protein from Escherichia coli (2005)
Výsledek druhu JRIV/00216208:11320/03:00002096 - Molecular dynamics simulations of DNA triplexes containing modified Hoogsteen strands - potential candidates for antigene therapy (2003)
Výsledek druhu DRIV/00216208:11320/03:00002508 - Molecular Dynamics Simulations of Potential Candidates for Antigene Therapy (2003)
Výsledek druhu DRIV/00216208:11320/02:00003621 - Explicit Solvent Molecular Dynamics Simulations of Helical Structures Formed by Modified Oligonucleotides with Shortened Phosphonate Internucleoside Linkages and Their Natural Counterparts (2002)
Tuto aplikaci pro Radu pro výzkum, vývoj a inovace provozuje Výpočetní a informační centrum Českého vysokého učení technického v Praze. Vyvíjí InfoScience Praha s.r.o.. Verze aplikace 1.6.15. Datové schéma ISVAV_WEB5_00304. Podpora uživatelů na e-mailové adrese podpora (zavináč) isvav (tečka) cz nebo telefonním čísle 224 234 797 (v pracovních dnech 8-16 hod.).