| | |
|---|
| Údaje o projektu |
| Identifikační kód | GA204/05/0939 |
| Důvěrnost údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Název v původním jazyce | CpG methylace lidských endogenních retrovirů a LINE |
| Poskytovatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Program | GA - Standardní projekty (1993-…) |
| Kategorie VaV | ZV - Základní výzkum |
| Hlavní obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Vedlejší obor | EE - Mikrobiologie, virologie |
| Zahájení řešení | 1.1.2005 |
| Ukončení řešení | 31.12.2007 |
| Datum posledního uvolnění účelové podpory | 2.5.2007 |
| Číslo smlouvy | 204/05/0939 |
| Poslední stav řešení | U - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení |
| Finance projektu | |
| Období | 2005 | 2006 | 2007 | celkem |
|---|
| Výše podpory ze státního rozpočtu | 1 310 tis. Kč | 1 082 tis. Kč | 1 255 tis. Kč | 3 647 tis. Kč |
| Celkové uznané náklady | 1 310 tis. Kč | 1 082 tis. Kč | 1 255 tis. Kč | 3 647 tis. Kč |
| Typ | skutečně čerpané | skutečně čerpané | skutečně čerpané |
|
| Druh soutěže | VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji |
| Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích | SGA02005GA-ST - Veřejná soutěž (GA0/GA) |
| Cíle řešení v původním jazyce | Methylace DNA v dinukleotidech CpG je klíčovým regulátorem genové exprese u obratlovců, zejména u teplokrevných, a většina dinukleotidů CpG mimo CpG ostrovy je methylována na cytosinu. To platí zejména pro sekvence retrotransposonů a retroelementů, kteréjsou všeobecně považovány za genomové parasity. Není však známo téměř nic o methylaci jednotlivých kopií těchto elementů, ačkoli tvoří podstatnou část lidského genomu. V rámci předkládaného projektu bychom chtěli porovnat úroveň methylace u vybraných lidských LINE z evolučně mladých a naopak starých rodin, a to zejména s ohledem na jejich retrotransposiční aktivitu. Dále budeme analysovat methylaci v dlouhých koncových opakovaných sekvencích (LTR) u vybraných členů lidských endogenních retrovirů rodiny W (HERV-W) a jejich pseudogenů generovaných pomocí LINE. Zvláštní pozornost pak věnujeme syncytinu, úplnému HERV-W na chromosomu 17, který kóduje protein navozující fúzi buněk při diferenciaci syncytiotrofoblastu v placentě. Zde bychom se chtěli |
| Klíčová slova v anglickém jazyce | endogenous retroviruses; LINEs; syncythin; DNA methylation |
| Hodnocení výsledků | U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory |
| Zhodnocení výsledků řešení česky | Popsali jsme epigenetické regulace lidských endogenních retrovirů kódujících fúsogenní obalové glykoproteiny (syncytiny 1 a 2) a prokázali jsme jejich účinnou inaktivaci pomocí methylace DNA ve všech tkáních mimo placentu a varlata. V testikulárních tkán |
| Rok dodání údajů do CEP | 2008 |
| Systémové označení dodávky dat | CEP08-GA0-GA-U/04:3 |
| Datum dodání záznamu | 16.12.2008 |
| Účastníci projektu |
| Počet příjemců | 1 |
| Počet dalších účastníků projektu | 0 |
| Příjemce | Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. |
| Řešitel | RNDr. Jiří Hejnar, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Finance účastníků projektu |
| Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007 |
| Výše podpory ze státního rozpočtu | |
| Účastník | 2007 |
|---|
| Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. | 1 255 tis. Kč |
|
| Celkové uznané náklady | |
| Účastník | 2007 |
|---|
| Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i. | 1 255 tis. Kč |
|
| Výsledky projektu v RIV |
| Počet výsledků v RIV | 3 |
| Výsledek druhu J | RIV/68378050:_____/09:00333948 - CpG methylation controls reactivation of HIV from latency (2009) |
| Výsledek druhu J | RIV/68378050:_____/08:00310881 - The core element of a CpG island protects avian sarcoma and leukosis virus-derived vectors from transcriptional silencing (2008) |
| Výsledek druhu J | RIV/68378050:_____/06:00030963 - CpG methylation suppresses transcriptional activity of human syncytin-1 in non-placental tissues (2006) |
nebo telefonním čísle 224 234 797 (v pracovních dnech 8-16 hod.).