| | |
|---|
| Údaje o projektu |
| Identifikační kód | GA203/05/0106 |
| Důvěrnost údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Název v původním jazyce | Význam trans-translace v buněčné diferenciaci a rezistenci k produkovaným antibiotikům u streptomycet |
| Poskytovatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Program | GA - Standardní projekty (1993-…) |
| Kategorie VaV | ZV - Základní výzkum |
| Hlavní obor | CE - Biochemie |
| Vedlejší obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Další vedlejší obor | EE - Mikrobiologie, virologie |
| Zahájení řešení | 1.1.2005 |
| Ukončení řešení | 31.12.2007 |
| Datum posledního uvolnění účelové podpory | 2.5.2007 |
| Číslo smlouvy | 203/05/0106 |
| Poslední stav řešení | U - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení |
| Finance projektu | |
| Období | 2005 | 2006 | 2007 | celkem |
|---|
| Výše podpory ze státního rozpočtu | 583 tis. Kč | 583 tis. Kč | 593 tis. Kč | 1 759 tis. Kč |
| Celkové uznané náklady | 583 tis. Kč | 583 tis. Kč | 593 tis. Kč | 1 759 tis. Kč |
| Typ | skutečně čerpané | skutečně čerpané | skutečně čerpané |
|
| Druh soutěže | VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji |
| Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích | SGA02005GA-ST - Veřejná soutěž (GA0/GA) |
| Cíle řešení v původním jazyce | Transfer messenger RNA (tmRNA, SsrA, 10aS RNA) obsahuje aktivity tRNA i mRNA, které se uplatňují v unikátní kontrole kvality proteosyntézy (trans translace. Kmeny s inaktivovaným genem ssrA budou použity k vysvětlení, zda tmRNA ovlivňuje rychlost růstu, buněčnou diferenciaci, odpověď na stres nebo rezistenci k produkovaným antibiotikům u streptomycet. Disrupce ssrA genu bude provedena náhradou genové sekvence omega kazetou obsahující marker pro antibiotickou resistenci nebo jednostupňovou inaktivací pomocí PCR produktu umožňující rychlý vznik nepolární delece. K důkazu, že pozorované změny fenotypu u deltassrA kmenů jsou způsobeny inaktivací tmRNA bude použita komplementace pomocí multikopiového plasmidu nesoucího ssrA gen pod vlastním promotorem. Proteomické experimenty budou použity k identifikaci změn v expresi proteinů u deltassrA kmene a rodičovského kmene kultivovaného za stresových podmínek. Proteiny budou radioaktivně označeny 35S methioninem a po 2D elektroforetické separaci a |
| Klíčová slova v anglickém jazyce | trans-translation; cellular differentiation; resistance; antibiotics; Streptomycetes |
| Hodnocení výsledků | V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory. |
| Zhodnocení výsledků řešení česky | Mikroorganismy obsahují ribonukleoproteinové komplexy, které umožňují přesný tok informace z DNA na RNA a proteiny. Jeden z významých kontrolních mechanizmů zahrnuje transfer-messenger RNA (tmRNA, SsrA, 10Sa RNA). Cílem projektu bylo objasnit strukturu t |
| Rok dodání údajů do CEP | 2008 |
| Systémové označení dodávky dat | CEP08-GA0-GA-U/04:3 |
| Datum dodání záznamu | 16.12.2008 |
| Účastníci projektu |
| Počet příjemců | 1 |
| Počet dalších účastníků projektu | 0 |
| Příjemce | Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. |
| Řešitel | Doc. Karel Mikulík, DrSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Finance účastníků projektu |
| Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007 |
| Výše podpory ze státního rozpočtu | |
| Účastník | 2007 |
|---|
| Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. | 593 tis. Kč |
|
| Celkové uznané náklady | |
| Účastník | 2007 |
|---|
| Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i. | 593 tis. Kč |
|
| Výsledky projektu v RIV |
| Počet výsledků v RIV | 7 |
| Výsledek druhu J | RIV/61388971:_____/09:00320412 - tmRNA of Streptomyces collinus and Streptomyces griseus during the growth and in the presence of antibiotics (2009) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388971:_____/08:00311306 - Biocomputational prediction of small non-coding RNAs in Streptomyces (2008) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388971:_____/08:00313096 - SsrA genes of streptomycetes and association of proteins to the tmRNA during developm ent and cellular differentiation (2008) |
| Výsledek druhu C | RIV/61388971:_____/07:00095726 - Activity of ribosomes and tmRNA of Streptomyces aureofaciens during development and stress conditions induced by changes in temperature and the presence of antibiotics (2007) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388971:_____/07:00084702 - Effect of Protein Kinase Inhibitors on Protein Phosphorylation and Germination of Aerial Spores from Streptomyces coelicolor (2007) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388971:_____/07:00093044 - tmRNA Abundance in Streptomyces aureofaciens, S. griseus and S. collinus under Stress-Inducing Conditions (2007) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388971:_____/06:00051220 - Activity of Translation System and Abundance of tmRNA during Development of Streptomyces aureofaciens Producing Tetracycline (2006) |