| | |
|---|
| Údaje o projektu |
| Identifikační kód | GA202/05/0628 |
| Důvěrnost údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Název v původním jazyce | Neinvazivní fyzikální diagnostika molekulárních interakcí při regulaci genové exprese |
| Poskytovatel | GA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR) |
| Program | GA - Standardní projekty (1993-…) |
| Kategorie VaV | ZV - Základní výzkum |
| Hlavní obor | BO - Biofyzika |
| Vedlejší obor | BH - Optika, masery a lasery |
| Další vedlejší obor | CE - Biochemie |
| Zahájení řešení | 1.1.2005 |
| Ukončení řešení | 31.12.2007 |
| Datum posledního uvolnění účelové podpory | 2.5.2007 |
| Číslo smlouvy | 202/05/0628 |
| Poslední stav řešení | U - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení |
| Finance projektu | |
| Období | 2005 | 2006 | 2007 | celkem |
|---|
| Výše podpory ze státního rozpočtu | 1 495 tis. Kč | 1 577 tis. Kč | 1 623 tis. Kč | 4 695 tis. Kč |
| Celkové uznané náklady | 1 495 tis. Kč | 1 577 tis. Kč | 1 623 tis. Kč | 4 695 tis. Kč |
| Typ | skutečně čerpané | skutečně čerpané | skutečně čerpané |
|
| Druh soutěže | VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji |
| Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacích | SGA02005GA-ST - Veřejná soutěž (GA0/GA) |
| Cíle řešení v původním jazyce | Budou rozvinuté účinné optické metody citlivého sledování biomolekulárních interakcí v malých objemech vzorků bez nutnosti zavádění molekulárních značek do interakčního místa a budou aplikované při studiu těch interakcí nukleová kyselina - protein, kteréhrají významnou roli v regulaci genové exprese a v "antisense" terapii. U vybraných štěpících a regulačních enzymů bude sledována tvorba, struktura a biochemická aktivita jejich komplexů s nukleovými kyselinami. Metodický vývoj bude zahrnovat (i) technické a matematické řešení přesných měření Ramanova rozptylu v nmol množstvích, (ii) konstrukci senzorového systému vysokého rozlišení s až osmi v reálném čase měřícími kanály, založeném na rezonanci povrchových plasmonů, (iii) vypracování komplexních interakčních modelů pro biomolekuly zahrnujících i vliv hydrodynamických podmínek, (iv) přípravu modifikovaných oligonukleotidů s různou strukturou cukr - fosfátové páteře. |
| Klíčová slova v anglickém jazyce | Raman; plasmon resonance; sensor; nucleic acid; protein; antisense |
| Hodnocení výsledků | V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory. |
| Zhodnocení výsledků řešení česky | V souladu s plánovanými cíli projektu byla vyvinuta nová technika a metodické postupy pro citlivé experimentální sledování interakcí nukleových kyselin (NA) významných z hlediska genové exprese a jejího cíleného ovlivňování při oligonukleotidové terapii. |
| Rok dodání údajů do CEP | 2008 |
| Systémové označení dodávky dat | CEP08-GA0-GA-U/04:3 |
| Datum dodání záznamu | 16.12.2008 |
| Účastníci projektu |
| Počet příjemců | 1 |
| Počet dalších účastníků projektu | 2 |
| Příjemce / Organizační jednotka garantující řešení | Univerzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta |
| Řešitel | Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Další účastník projektu | Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. |
| Řešitel | Ing. Ivan Rosenberg, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Další účastník projektu | Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i. |
| Řešitel | Ing. Jiří Homola, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Finance účastníků projektu |
| Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007 |
| Výše podpory ze státního rozpočtu | |
| Účastník | 2007 |
|---|
| Univerzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta | 655 tis. Kč |
| Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. | 397 tis. Kč |
| Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i. | 571 tis. Kč |
|
| Celkové uznané náklady | |
| Účastník | 2007 |
|---|
| Univerzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta | 655 tis. Kč |
| Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. | 397 tis. Kč |
| Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i. | 571 tis. Kč |
|
| Výsledky projektu v RIV |
| Počet výsledků v RIV | 11 |
| Výsledek druhu J | RIV/67985882:_____/09:00332731 - Surface plasmon resonance study on HIV-1 integrase strand transfer activity (2009) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388963:_____/08:00306258 - A new linker for solid-phase synthesis of oligonucleotides with terminal phosphate group (2008) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388963:_____/07:00092802 - Electrophile-promoted addition of hydroxymethylphosphonate to 4',5'-didehydronucleosides: a way to novel isosteric analogues of 5'-nucleotides (2007) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388963:_____/07:00093724 - Ring Enlargement of Cyclic Acetals and Ketals: A Way to Seven-Membered Nucleoside Phostones (2007) |
| Výsledek druhu J | RIV/67985882:_____/07:00081290 - Towards parrallelized surface plasmon resonance sensor platform for sensitive detection of oligonucleotides (2007) |
| Výsledek druhu J | RIV/67985882:_____/06:00040514 - Investigating oligonucleotide hybridization at subnanomolar level by surface plasmon resonance biosensor method (2006) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388963:_____/06:00042126 - Novel isosteric, isopolar phosphonate analogs of oligonucleotides: Preparation and properties (2006) |
| Výsledek druhu J | RIV/61388963:_____/06:00076346 - Oxidative cleavage of ribofuranose 5-(alpha-hydroxyphosphonates): a route to erythrofuranose-based nucleoside phosphonic acids (2006) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216208:11320/06:00002251 - Studium oligonukleotidů pokročilými technikami optické spektroskopie (2006) |
| Výsledek druhu D | RIV/67985882:_____/06:00031091 - Surface plasmon resonance (SPR) biosensors and their applications in food safety and security (2006) |
| Výsledek druhu J | RIV/00216208:11320/05:00000533 - Drop coating deposition Raman - a new method in Raman spectroscopy for biomolecular saples of low concetrations (2005) |