• česky
  • english

GA202/05/0628 - Neinvazivní fyzikální diagnostika molekulárních interakcí při regulaci genové exprese (2005-2007, GA0/GA)

Údaje o projektu
Identifikační kódGA202/05/0628
Důvěrnost údajůS - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
Název v původním jazyceNeinvazivní fyzikální diagnostika molekulárních interakcí při regulaci genové exprese
PoskytovatelGA0 - Grantová agentura České republiky (GA ČR)
ProgramGA - Standardní projekty (1993-…)
Kategorie VaVZV - Základní výzkum
Hlavní oborBO - Biofyzika
Vedlejší oborBH - Optika, masery a lasery
Další vedlejší oborCE - Biochemie
Zahájení řešení1.1.2005
Ukončení řešení31.12.2007
Datum posledního uvolnění účelové podpory2.5.2007
Číslo smlouvy202/05/0628
Poslední stav řešeníU - Ukončený projekt, tj. jednoletý nebo víceletý projekt, který skončil v předcházejícím roce, v příslušném roce sběru dat jsou dodány údaje vztahující se k jeho ukončení
Finance projektu
Období200520062007celkem
Výše podpory ze státního rozpočtu1 495 tis. Kč1 577 tis. Kč1 623 tis. Kč4 695 tis. Kč
Celkové uznané náklady1 495 tis. Kč1 577 tis. Kč1 623 tis. Kč4 695 tis. Kč
Typskutečně čerpanéskutečně čerpanéskutečně čerpané
Druh soutěžeVS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
Veřejná soutěž ve výzkumu, vývoji a inovacíchSGA02005GA-ST - Veřejná soutěž (GA0/GA)
Cíle řešení v původním jazyceBudou rozvinuté účinné optické metody citlivého sledování biomolekulárních interakcí v malých objemech vzorků bez nutnosti zavádění molekulárních značek do interakčního místa a budou aplikované při studiu těch interakcí nukleová kyselina - protein, kteréhrají významnou roli v regulaci genové exprese a v "antisense" terapii. U vybraných štěpících a regulačních enzymů bude sledována tvorba, struktura a biochemická aktivita jejich komplexů s nukleovými kyselinami. Metodický vývoj bude zahrnovat (i) technické a matematické řešení přesných měření Ramanova rozptylu v nmol množstvích, (ii) konstrukci senzorového systému vysokého rozlišení s až osmi v reálném čase měřícími kanály, založeném na rezonanci povrchových plasmonů, (iii) vypracování komplexních interakčních modelů pro biomolekuly zahrnujících i vliv hydrodynamických podmínek, (iv) přípravu modifikovaných oligonukleotidů s různou strukturou cukr - fosfátové páteře.
Klíčová slova v anglickém jazyceRaman; plasmon resonance; sensor; nucleic acid; protein; antisense
Hodnocení výsledkůV - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
Zhodnocení výsledků řešení českyV souladu s plánovanými cíli projektu byla vyvinuta nová technika a metodické postupy pro citlivé experimentální sledování interakcí nukleových kyselin (NA) významných z hlediska genové exprese a jejího cíleného ovlivňování při oligonukleotidové terapii.
Rok dodání údajů do CEP2008
Systémové označení dodávky datCEP08-GA0-GA-U/04:3
Datum dodání záznamu16.12.2008
Účastníci projektu
Počet příjemců1
Počet dalších účastníků projektu2
Příjemce / Organizační jednotka garantující řešeníUniverzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta
ŘešitelProf. RNDr. Josef Štěpánek, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Další účastník projektuÚstav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
ŘešitelIng. Ivan Rosenberg, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Další účastník projektuÚstav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i.
ŘešitelIng. Jiří Homola, CSc. (státní příslušnost: CZ - Česká republika)
Finance účastníků projektu
Poznámka: Finance účastníků projektu jsou sledovány od roku 2007
Výše podpory ze státního rozpočtu
Účastník2007
Univerzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta655 tis. Kč
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.397 tis. Kč
Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i.571 tis. Kč
Celkové uznané náklady
Účastník2007
Univerzita Karlova v Praze / Matematicko-fyzikální fakulta655 tis. Kč
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.397 tis. Kč
Ústav fotoniky a elektroniky AV ČR, v. v. i.571 tis. Kč
Výsledky projektu v RIV
Počet výsledků v RIV11
Výsledek druhu JRIV/67985882:_____/09:00332731 - Surface plasmon resonance study on HIV-1 integrase strand transfer activity (2009)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/08:00306258 - A new linker for solid-phase synthesis of oligonucleotides with terminal phosphate group (2008)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/07:00092802 - Electrophile-promoted addition of hydroxymethylphosphonate to 4',5'-didehydronucleosides: a way to novel isosteric analogues of 5'-nucleotides (2007)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/07:00093724 - Ring Enlargement of Cyclic Acetals and Ketals: A Way to Seven-Membered Nucleoside Phostones (2007)
Výsledek druhu JRIV/67985882:_____/07:00081290 - Towards parrallelized surface plasmon resonance sensor platform for sensitive detection of oligonucleotides (2007)
Výsledek druhu JRIV/67985882:_____/06:00040514 - Investigating oligonucleotide hybridization at subnanomolar level by surface plasmon resonance biosensor method (2006)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/06:00042126 - Novel isosteric, isopolar phosphonate analogs of oligonucleotides: Preparation and properties (2006)
Výsledek druhu JRIV/61388963:_____/06:00076346 - Oxidative cleavage of ribofuranose 5-(alpha-hydroxyphosphonates): a route to erythrofuranose-based nucleoside phosphonic acids (2006)
Výsledek druhu JRIV/00216208:11320/06:00002251 - Studium oligonukleotidů pokročilými technikami optické spektroskopie (2006)
Výsledek druhu DRIV/67985882:_____/06:00031091 - Surface plasmon resonance (SPR) biosensors and their applications in food safety and security (2006)
Výsledek druhu JRIV/00216208:11320/05:00000533 - Drop coating deposition Raman - a new method in Raman spectroscopy for biomolecular saples of low concetrations (2005)