| | |
|---|
| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/68081766:_____/06:00042520 |
| Název v původním jazyce | Duplication, balancing selection and trans-species evolution explain the high levels of polymorphism of the DQA MHC class II gene in voles (Arvicolinae) |
| Název česky | Duplikace, balancující selekce a trans-species evoluce vysvětlují vysoký stupeň polymorfismu genu DQA (MHC Class II) u hrabošů (Arvicolinae) |
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Uplatnění | U - Výsledek uplatněný (publikovaný, realizovaný, atp.) |
| Rok uplatnění | 2006 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Údaje z Hodnocení 2009 |
| Druh výsledku v hodnocení | Jimp - Článek v impaktovaném časopise |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Metodika hodnocení, rok uplatnění do 2007 včetně, J_imp článek v impaktovaném časopise. |
| Bodové ohodnocení | 22,788 |
| Rozdělení výsledku mezi výzkumné organizace |
|
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 4 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Tvůrce | Bryja Josef (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; G - garant výsledku) |
| Tvůrce | Galan M. (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) |
| Tvůrce | Charbonnel N. (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) |
| Tvůrce | Cosson J.-F. (státní příslušnost: FR - Francouzská republika) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | We described the structure and diversity of exon 2 of the MHC class II DQA gene in three species of voles (Arvicolinae) exhibiting regular multi-annual fluctuations of population density and analysed the processes leading to the observed MHC polymorphism. All exon 2 sequences translate to give unique amino acid sequences and positive selection was found to act very intensively on antigen binding sites. We documented the presence of recombination at vole DQA region but its importance in generating allelic polymorphism seems to be relatively limited. For the first time with rodents, we documented the duplication of the DQA gene in all three species with both copies being transcriptionally active. |
| Popis česky | Použitím klonování, sekvenování a SSCP byl popsán polymorfismus DQA genu (MHC Class II) u tří druhů hrabošovitých hlodavců. Všechny sekvence exonu 2 jsou jedinečně přepisovatelné a vykazují známky balancující selekce (trans-species evoluce, vysoký počet mutací v pozicích kódujících ABS). Poprvé u hlodavců je zjištěna duplikace DQA genu u všech tří sledovaných druhů. |
| Klíčová slova | Muridae; allelic diversity |
| Název periodka | Immunogenetics |
| Rozsah stran | 191;202 |
| ISSN | 0093-7711 |
| Svazek periodika | 58 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 2-3 |
| Stát vydavatele periodika | DE - Spolková republika Německo |
| Počet stran výsledku | 12 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i. |
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR) |
| Rok sběru | 2007 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV07-AV0-68081766/02:2 |
| Jiný výskyt tohoto výsledku se v RIV nenachází | |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Výzkumný záměr | AV0Z60930519 - Biodiverzita a ekologie obratlovců: Strategie ochrany a využívání přírodních populací (2005-2011, AV0) |