| | |
|---|
| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/60077409:_____/05:00025690 |
| Název v původním jazyce | Phylogenetic analysis of freshwater fish trypanosomes from Europe using ssu rRNA gene sequences and random amplification of polymorphic DNA |
| Název česky | Fylogenetická analýza trypanosom sladkovodních ryb Evropy využívající sekvence ssu rRNA genu a polymorfismus náhodně amplifikované DNA |
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | EA - Morfologické obory a cytologie |
| Uplatnění | U - Výsledek uplatněný (publikovaný, realizovaný, atp.) |
| Rok uplatnění | 2005 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 1 |
| Údaje z Hodnocení 2009 |
| Druh výsledku v hodnocení | Jimp - Článek v impaktovaném časopise |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Metodika hodnocení, rok uplatnění do 2007 včetně, J_imp článek v impaktovaném časopise. |
| Bodové ohodnocení | 34,167 |
| Rozdělení výsledku mezi výzkumné organizace |
|
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 5 |
| Počet domácích tvůrců | 2 |
| Tvůrce | Gibson W. C. (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) |
| Tvůrce | Lom Jiří (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; G - garant výsledku) |
| Tvůrce | Pecková Hana (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce) |
| Tvůrce | Ferris V. R. (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) |
| Tvůrce | Hamilton P. B. (státní příslušnost: GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | A collection of 22 cloned trypanosome isolates from 14 species of European freshwater fish and 1 species of African freshwater fish were examined by phylogenetic analysis. SSU rRNA genes of 8 isolates were sequenced and compared with sequences from a wide selection of vertebrate trypanosome isolates. All freshwater isolates fell in a single clade, subdivided into 3 groups. This clade sits within a robust clade of trypanosomes from marine fish, amphibia, reptiles and the duck-billed platypus. All 22 trypanosome clones were analysed by RAPD. The resulting tree shows 3 groups congruent with the groups identified in the ssu rRNA gene phylogeny. Two of these groups contain the majority of isolates. These groups do not separate trypanosome species distinguished by morphology or host origin, and thus these criteria do not appear to be reliable guides to genetic relationships among fish trypanosomes. The two groups themselves may represent different species of fish trypanosomes. |
| Popis česky | Molekulárně fylogenetickými metodami bylo analyzováno 22 klonů trypanosom izolovaných ze 14 druhů sladkovodních ryb. SSU rRNA geny 8 klonů byly sekvenovány a porovnány se sekvencemi ssu rRNA genů trypanosom širšího souboru obratlovců. Všechny trypanosomy ze sladkovodních ryb spadly do jednoho kladu rozděleného na 3 skupiny. Tento klad je součástí většího robustního kladu obsahujícího trypanosomy mořských ryb a různých obojživelníků. Všech 22 klonů trypanosom bylo analyzováno metodou RAPD. Výsledný dendrogram ukazuje 3 skupiny, které jsou shodné se skupinami identifikovanými ve fylogenezi ssu rRNA genu. Dvě skupiny obsahují většinu izolátů trypanosom, rozdíly uvnitř skupin jsou jen malé. Tyto skupiny neoddělují druhy trypanosom rozlišené podle morfologie nebo původu hostitele. Použitá kritéria tedy nejsou spolehlivými vodítky pro zjišťování genetické příbuznosti rybích trypanosom. Výsledky práce naznačují, že 2 skupiny samy o sobě mohou představovat rozdílné druhy trypanosom ryb. |
| Klíčová slova | trypanosomes; freshwater fish; phylogeny |
| Název periodka | Parasitology |
| Rozsah stran | 405;412 |
| ISSN | 0031-1820 |
| Svazek periodika | 130 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 4 |
| Stát vydavatele periodika | GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska |
| Počet stran výsledku | 8 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Parazitologický ústav AV ČR |
| Dodavatel | AV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR) |
| Rok sběru | 2006 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV06-AV0-60077409/03:2 |
| Jiný výskyt tohoto výsledku se v RIV nenachází | |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Výzkumný záměr | AV0Z60220518 - Parazitismus a parazito-hostitelské vztahy na organismální, buněčné a molekulové úrovni (2005-2011, AV0) |
