• česky
  • english

RIV/60077409:_____/05:00025664 - RNA interference analyses suggest a transcript-specific regulatory role for mitochondrial RNA-binding proteins MRP1 and MRP2 in RNA editing and other RNA processing in Trypanosoma brucei (2005)

Údaje o výsledku
Identifikační kódRIV/60077409:_____/05:00025664
Název v původním jazyceRNA interference analyses suggest a transcript-specific regulatory role for mitochondrial RNA-binding proteins MRP1 and MRP2 in RNA editing and other RNA processing in Trypanosoma brucei
Název českyAnalýza prostřednictvím interference RNA ukazuje na transkripčně specifickou úlohu mitochondriálních RNA-vážících proteinů MRP1 a MRP2 při editování RNA a dalších úpravách RNA u Trypanosoma brucei
DruhJ - Článek v odborném periodiku
Jazykeng - angličtina
OborEB - Genetika a molekulární biologie
UplatněníU - Výsledek uplatněný (publikovaný, realizovaný, atp.)
Rok uplatnění2005
Kód důvěrnosti údajůS - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
Počet výskytů výsledku2
Údaje z Hodnocení 2009
Druh výsledku v hodnoceníJimp - Článek v impaktovaném časopise
Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledkuMetodika hodnocení, rok uplatnění do 2007 včetně, J_imp článek v impaktovaném časopise.
Bodové ohodnocení62,754
Rozdělení výsledku mezi výzkumné organizace
Výzkumná organizacePodílBody
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.75,0 %47,065
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta25,0 %15,688
Tvůrci výsledku
Počet tvůrců celkem7
Počet domácích tvůrců3
TvůrceHoráková Eva (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; G - garant výsledku)
TvůrceVan Den Burg J. (státní příslušnost: NL - Nizozemské království)
TvůrceZíková Alena (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce)
TvůrceErnst N. L. (státní příslušnost: US - Spojené státy americké)
TvůrceStuart K. (státní příslušnost: US - Spojené státy americké)
TvůrceBenne R. (státní příslušnost: NL - Nizozemské království)
TvůrceLukeš Julius (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce)
Údaje blíže specifikující výsledek
Popis v původním jazyceMitochondrial RNA binding proteins MRP1 and MRP2 occur in a heteromeric complex that appears to play a role in U-insertion/deletion editing in trypanosomes. Reduction in the levels of MRP 1 (gBP21) and/or MRP2 (gBP25) mRNA by RNA interference (RNAi) in procyclic Trypanosoma brucei resulted in severe growth inhibition. It also resulted in the loss of both proteins, even when only one of the MRPs mRNAs was reduced, indicating a mutual dependence for stability. Elimination of the MRPs gave rise to substantially reduced levels of edited cyB and RPS12 mRNAs, but little or no reduction of the level of edited cox2, cox3 and A6 mRNAs, as measured by poisoned primer extension analyses. In contrast, edited ND7 mRNA was increased five-fold in MRP1+2 double knockdown cells. These data indicate that MRP1 and MRP2 are not essential for RNA editing per se, but rather play a regulatory role in the editing of specific transcripts and other RNA processing activities.
Popis českyMitochondriální RNA-vážící proteiny MRP1 a MRP2 se vyskytují v heteromerickém komplexu, který patrně hraje roli v inserčním-delečním editování u trypanosom. Snížení hladiny mRNA pro MRP1 (gBP21) a-nebo MRP2 (gBP25) prostřednictvím interference RNA (RNAi) u procyklických stádií Trypanosoma brucei způsobuje závažnou poruchu růstu. Rovněž došlo ke ztrátě obou proteinů, což naznačuje jejich vzájemnou závislost ohledně stability. Vymizení MRP proteinů způsobilo významný pokles editovaných mRNA pro cyB a RPS12, ale pouze malé snížení editovaných cox2, cox3 a A6. Avšak množství editované mRNA pro ND7 se v dvojitých knock-downech 5x zvýšilo. Navíc způsobila eliminace MRP proteinů snížení hladiny mRNA pro cox1, ND4 a ND5, což jsou needitované molekuly. Tyto výsledky naznačují, že MRP1 a MRP2 nejsou pro samotné editování RNA nezbytné, avšak hrají regulační úlohu při editování specifických transkriptů a zúčastňují se dalších úprav RNA molekul.
Klíčová slovaTrypanosoma brucei; RNA editing; interference RNA
Název periodkaJournal of Biological Chemistry
Rozsah stran2429;2438
ISSN0021-9258
Svazek periodika280
Číslo periodika v rámci uvedeného svazku4
Stát vydavatele periodikaUS - Spojené státy americké
Počet stran výsledku10
Údaje o tomto záznamu o výsledku
PředkladatelParazitologický ústav AV ČR
DodavatelAV0 - Akademie věd České republiky (AV ČR)
Rok sběru2006
Systémové označení dodávky datRIV06-AV0-60077409/03:2
Další výskyty tohoto výsledku od jiných předkladatelů
Další předkladatelJihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Dodáno MŠMT v roce 2006Záznam s identifikačním kódem RIV/60076658:12310/05:00006381 v dodávce dat RIV06-MSM-12310___/01:1
Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl
ProjektIAA6022903 - Fylogenetická analýza vybraných prvoků (Bodonina a Coccidia) prostřednictvím SSU rRNA a konzervativních proteinů (1999-2001, AV0/IA)
Výzkumný záměrAV0Z60220518 - Parazitismus a parazito-hostitelské vztahy na organismální, buněčné a molekulové úrovni (2005-2011, AV0)
Výzkumný záměrMSM 123100003 - Molekulární mechanismy evoluce a ekologie v biologických systémech (1999-2004, MSM)