| | |
|---|
| Údaje o výsledku |
| Identifikační kód | RIV/60076658:12310/05:00006381 |
| Název v původním jazyce | RNA Interference Analyses Suggest a Transcript-specific Regulatory Role for Mitochondrial RNA-binding Proteins MRP1 and MRP2 in RNA Editing and Other RNA Processing in Trypanosoma brucei |
| Název česky | Analýza prostřednictvím interference RNA ukázuje na transkripčně specifickou úlohu MRP1 a MRP2 při editování RNA a dalších úpravách RNA u Trypanosoma brucei. |
| Druh | J - Článek v odborném periodiku |
| Jazyk | eng - angličtina |
| Obor | EB - Genetika a molekulární biologie |
| Uplatnění | U - Výsledek uplatněný (publikovaný, realizovaný, atp.) |
| Rok uplatnění | 2005 |
| Kód důvěrnosti údajů | S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů |
| Počet výskytů výsledku | 2 |
| Údaje z Hodnocení 2009 |
| Druh výsledku v hodnocení | Jimp - Článek v impaktovaném časopise |
| Konkrétní způsob(y) hodnocení výsledku | Metodika hodnocení, rok uplatnění do 2007 včetně, J_imp článek v impaktovaném časopise. |
| Bodové ohodnocení | 62,754 |
| Rozdělení výsledku mezi výzkumné organizace |
|
|
| Tvůrci výsledku |
| Počet tvůrců celkem | 7 |
| Počet domácích tvůrců | 1 |
| Tvůrce | Vondrušková Eva (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | van den Burg Janny (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | Zíková Alena (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | Ernst N. L. (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | Stuart Kenneth (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | Benne Rob (státní příslušnost: CZ - Česká republika) |
| Tvůrce | Lukeš Julius (státní příslušnost: CZ - Česká republika; A - domácí tvůrce; G - garant výsledku) |
| Údaje blíže specifikující výsledek |
| Popis v původním jazyce | Mitochondrial RNA-binding proteins MRP1 andMRP2 occur in a heteromeric complex that appears toplay a role in U-insertion/deletion editing in trypanosomes.Reduction in the levels of MRP1 (gBP21) and/orMRP2 (gBP25) mRNA by RNA interference in procyclicTrypanosoma brucei resulted in severe growth inhibition.It also resulted in the loss of both proteins, evenwhen only one of the MRP mRNAs was reduced, indicatinga mutual dependence for stability. Elimination ofthe MRPs gave rise to substantially reduced levels ofedited CyB and RPS12 mRNAs but little or no reductionof the level of edited Cox2, Cox3, and A6 mRNAs asmeasured by poisoned primer extension analyses. Incontrast, edited NADH-dehydrogenase (ND) subunit 7mRNA was increased 5-fold in MRP12 double knockdowncells. Furthermore, MRP elimination resulted inreduced levels of Cox1, ND4, and ND5 mRNAs, which arenever edited, whereas mitoribosomal 12 S rRNA levelswere not affected. These data indicate that MRP1 andMRP2 are not essential for RNA editing per se |
| Popis česky | Mitochondriální RNA-vážící proteiny MRP1 a MRP2 se vyskytují v heteromerickém komplexu, který patrně hraje roli v inserčním-delečním editování u trypanosom. Snížení hladiny mRNA pro MRP1 (gBP21) a-nebo MRP2 (gBP25) prostřednictvím interference RNA (RNAi) u procyklických stádií Trypanosoma brucei způsobuje závažnou poruchu růstu. Rovněž došlo ke ztrátě obou proteinů, což naznačuje jejich vzájemnou závislost ohledně stability. Vymizení MRP proteinů způsobilo významný pokles editovaných mRNA pro cyB a RPS12, ale pouze malé snížení editovaných cox2, cox3 a A6. Avšak množství editované mRNA pro ND7 se v dvojitých knock-downech 5x zvýšilo. Navíc způsobila eliminace MRP proteinů snížení hladiny mRNA pro cox1, ND4 a ND5, což jsou needitované molekuly. Tyto výsledky naznačují, že MRP1 a MRP2 nejsou pro samotné editování RNA nezbytné, avšak hrají regulační úlohu při editování specifických transkriptů a zúčastňují se dalších úprav RNA molekul. |
| Klíčová slova | RNA Interference; Trypanosoma brucei; MRP1 andMRP2 |
| Název periodka | Journal of Biological Chemistry |
| Rozsah stran | 2429-2438 |
| ISSN | 0021-9258 |
| Svazek periodika | 280 |
| Číslo periodika v rámci uvedeného svazku | 4 |
| Stát vydavatele periodika | US - Spojené státy americké |
| Počet stran výsledku | 10 |
| Údaje o tomto záznamu o výsledku |
| Předkladatel | Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta |
| Dodavatel | MSM - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy (MŠMT) |
| Rok sběru | 2006 |
| Systémové označení dodávky dat | RIV06-MSM-12310___/01:1 |
| Další výskyty tohoto výsledku od jiných předkladatelů |
| Další předkladatel | Parazitologický ústav AV ČR |
| Dodáno AV ČR v roce 2006 | Záznam s identifikačním kódem RIV/60077409:_____/05:00025664 v dodávce dat RIV06-AV0-60077409/03:2 |
| Odkazy na výzkumné aktivity, při jejichž řešení výsledek vznikl |
| Projekt | IAA6022903 - Fylogenetická analýza vybraných prvoků (Bodonina a Coccidia) prostřednictvím SSU rRNA a konzervativních proteinů (1999-2001, AV0/IA) |
| Výzkumný záměr | AV0Z60220518 - Parazitismus a parazito-hostitelské vztahy na organismální, buněčné a molekulové úrovni (2005-2011, AV0) |
| Výzkumný záměr | MSM 123100003 - Molekulární mechanismy evoluce a ekologie v biologických systémech (1999-2004, MSM) |
